44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0253 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0253  hypothetical protein  100 
 
 		 885 aa  1814    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  40.41 
 
 		 1406 aa  431  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0709  hypothetical protein  32.66 
 
 		 733 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.247349  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  28.03 
 
 		 1029 aa  112  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2394  Fibronectin type III domain protein  34.5 
 
 		 580 aa  108  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.374405  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  34.13 
 
 		 1332 aa  107  8e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2491  Fibronectin type III domain protein  32.28 
 
 		 566 aa  102  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0356  hypothetical protein  29.14 
 
 		 1011 aa  88.2  6e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.161093  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2456  secreted metalloprotease  25.13 
 
 		 543 aa  84.3  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.055863 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1458  M6 family metalloprotease domain protein  25.48 
 
 		 1004 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000451067  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2442  cellulosome protein dockerin type I  33.33 
 
 		 870 aa  82.8  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000150479  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2675  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  28.33 
 
 		 834 aa  80.5  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343316 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  29.59 
 
 		 12684 aa  76.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4789  hypothetical protein  27.16 
 
 		 710 aa  72  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.148662  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2374  M6 family metalloprotease domain protein  25.59 
 
 		 566 aa  71.2  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239302  hitchhiker  0.000554149 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4783  hypothetical protein  26.38 
 
 		 701 aa  67.4  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.292143  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3802  protease  24.83 
 
 		 778 aa  61.2  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.239343 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.73 
 
 		 671 aa  59.7  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.202041  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1607  hypothetical protein  25.86 
 
 		 826 aa  58.9  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0443973  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3183  M6 family peptidase  26.89 
 
 		 480 aa  58.9  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.585369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2229  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.61 
 
 		 659 aa  58.5  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.167752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0791  hypothetical protein  33.05 
 
 		 692 aa  57.4  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.195904  normal  0.0459938 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3362  hypothetical protein  26.47 
 
 		 770 aa  55.5  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.142309  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1642  hypothetical protein  37.35 
 
 		 717 aa  54.3  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1900  hypothetical protein  25.36 
 
 		 504 aa  52.4  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0528132 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1944  hypothetical protein  41.94 
 
 		 679 aa  52  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.540087  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0670  hypothetical protein  39.73 
 
 		 1024 aa  51.6  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.680595  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1912  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  20.63 
 
 		 512 aa  51.2  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.722896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2144  peptidase M6, immune inhibitor A  26.61 
 
 		 513 aa  50.1  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0726754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2918  hypothetical protein  32.97 
 
 		 873 aa  49.3  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5648  hypothetical protein  24.34 
 
 		 518 aa  49.3  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004053  hypothetical protein  23.69 
 
 		 994 aa  48.5  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000445976  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2228  putative PAS/PAC sensor protein  22.15 
 
 		 652 aa  48.5  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0829706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  32.94 
 
 		 1266 aa  47  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1913  hypothetical protein  22.89 
 
 		 215 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.93 
 
 		 669 aa  45.8  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.142173  normal  0.0665505 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2132  hypothetical protein  37.14 
 
 		 646 aa  46.2  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5875  hypothetical protein  23.84 
 
 		 543 aa  45.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.191888 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2666  hypothetical protein  34.21 
 
 		 559 aa  45.4  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00626292  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3731  hypothetical protein  34.21 
 
 		 553 aa  45.4  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.280958  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1804  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  29.36 
 
 		 1482 aa  45.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49918  predicted protein  29.25 
 
 		 652 aa  45.4  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2849  fibronectin, type III domain-containing protein  32.58 
 
 		 489 aa  44.3  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00390509  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44705  predicted protein  23.62 
 
 		 735 aa  44.7  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>