156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0264 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 		 480 aa  966    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  32.5 
 
 		 1042 aa  176  7e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  35.62 
 
 		 1973 aa  157  4e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  33.25 
 
 		 3507 aa  155  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  34.02 
 
 		 2068 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  33.99 
 
 		 1363 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  33.77 
 
 		 1380 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0274  S-layer domain protein  34.4 
 
 		 779 aa  143  5e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.430281  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  32.68 
 
 		 1363 aa  143  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1040  fibronectin type III domain-containing protein  34.67 
 
 		 771 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3668  fibronectin type III domain-containing protein  35.67 
 
 		 836 aa  130  7.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  32.99 
 
 		 4433 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  31.46 
 
 		 680 aa  120  6e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2535  hypothetical protein  34.64 
 
 		 670 aa  120  7.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2202  fibronectin type III domain-containing protein  29.16 
 
 		 841 aa  114  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536559 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0071  multicopper oxidase type 2  35.6 
 
 		 1299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  31.09 
 
 		 1628 aa  110  5e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1360  fibronectin type III domain-containing protein  33.33 
 
 		 1247 aa  110  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858944  decreased coverage  0.000129137 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3156  Fibronectin type III domain protein  29.95 
 
 		 741 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0088  multicopper oxidase type 2  35.15 
 
 		 1299 aa  107  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516794  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1402  fibronectin, type III domain-containing protein  34.02 
 
 		 1248 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.215037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  32.18 
 
 		 2170 aa  97.8  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  42.03 
 
 		 409 aa  96.3  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  29.49 
 
 		 903 aa  95.1  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0432  Fibronectin type III domain protein  51.69 
 
 		 340 aa  95.5  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.25 
 
 		 795 aa  95.9  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  35.33 
 
 		 999 aa  94.7  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3289  PKD repeat-containing protein  34.59 
 
 		 995 aa  93.2  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745526  hitchhiker  0.000000829414 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  28.75 
 
 		 9585 aa  93.2  9e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2321  Fibronectin type III domain protein  29.22 
 
 		 701 aa  93.2  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0529  fibronectin, type III domain-containing protein  33.58 
 
 		 448 aa  91.7  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  30.74 
 
 		 2286 aa  91.7  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  32.76 
 
 		 527 aa  89.4  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  36.01 
 
 		 692 aa  87  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0334  Fibronectin type III domain protein  47.11 
 
 		 861 aa  86.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000091275  normal  0.913538 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  28.87 
 
 		 6885 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0682  Fibronectin type III domain protein  30.25 
 
 		 1735 aa  84.7  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  33.15 
 
 		 1199 aa  84.3  0.000000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1569  helix-turn-helix, AraC type  33.03 
 
 		 1113 aa  84  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1394  Fibronectin type III domain protein  36 
 
 		 1272 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.905341 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3108  multicopper oxidase type 2  36.06 
 
 		 1430 aa  80.5  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00507653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  24.71 
 
 		 803 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2630  fibronectin type III domain-containing protein  28.36 
 
 		 825 aa  77.8  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  32.47 
 
 		 1462 aa  77  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  37.86 
 
 		 2334 aa  76.6  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  35.33 
 
 		 648 aa  75.1  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2403  PA14 domain protein  28.42 
 
 		 1172 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  30.05 
 
 		 1067 aa  74.7  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  48.39 
 
 		 14944 aa  70.1  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.5 
 
 		 649 aa  69.7  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  31.46 
 
 		 1887 aa  68.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  30.64 
 
 		 918 aa  67.4  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1503  ATPase  31.67 
 
 		 674 aa  66.6  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000259399  hitchhiker  0.000359173 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  27.8 
 
 		 1221 aa  65.9  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  42.68 
 
 		 673 aa  65.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27230  subtilisin-like serine protease  28.33 
 
 		 801 aa  65.1  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0273209  normal  0.322238 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  30.22 
 
 		 1307 aa  65.1  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0456  hypothetical protein  30.34 
 
 		 1062 aa  64.7  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.97303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  36.46 
 
 		 1160 aa  64.3  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  35.71 
 
 		 776 aa  62.4  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  30.89 
 
 		 455 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  30.89 
 
 		 455 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2773  Fibronectin type III domain protein  25.44 
 
 		 690 aa  62  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000670095 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4401  lipolytic protein G-D-S-L family  27.41 
 
 		 728 aa  61.6  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0773  Fibronectin type III domain protein  28.09 
 
 		 554 aa  61.6  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.310071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  30.8 
 
 		 455 aa  60.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  32.24 
 
 		 743 aa  60.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  29.35 
 
 		 445 aa  60.5  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1543  cellulosome anchoring protein cohesin region  28.57 
 
 		 782 aa  60.5  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000430269  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  30.89 
 
 		 455 aa  60.1  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0068  fibronectin, type III domain-containing protein  28.22 
 
 		 1695 aa  60.1  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4308  Fibronectin type III domain protein  33.33 
 
 		 1377 aa  59.7  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0936224  hitchhiker  0.00620072 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  33.49 
 
 		 3802 aa  59.7  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  32.95 
 
 		 1050 aa  59.7  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  30.3 
 
 		 464 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  30.89 
 
 		 455 aa  58.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  30.61 
 
 		 465 aa  58.2  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  30.89 
 
 		 455 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  30.89 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  27.05 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3111  peptidase M12B, ADAM/reprolysin  30.98 
 
 		 715 aa  57.4  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.894939  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  30.89 
 
 		 455 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  25.62 
 
 		 1401 aa  57  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2394  Fibronectin type III domain protein  34.34 
 
 		 580 aa  57  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.374405  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1394  spore coat protein-related protein  38.24 
 
 		 1303 aa  56.6  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.617881  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  27.81 
 
 		 3333 aa  55.8  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2198  Fibronectin type III domain protein  29.26 
 
 		 2047 aa  55.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0185742 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0459  hypothetical protein  31.63 
 
 		 478 aa  55.5  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0813872  normal  0.0506125 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2022  fibronectin, type III domain-containing protein  29.36 
 
 		 683 aa  55.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00638663  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2863  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  35.35 
 
 		 672 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.515919  normal  0.787777 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  28.72 
 
 		 455 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2491  Fibronectin type III domain protein  32.48 
 
 		 566 aa  55.5  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  29.2 
 
 		 455 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  29.51 
 
 		 973 aa  54.7  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  44.3 
 
 		 2927 aa  54.7  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0022  fibronectin type III domain-containing protein  27.67 
 
 		 730 aa  54.7  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0168573  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0896  Fibronectin type III domain protein  26.32 
 
 		 804 aa  54.3  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  26.57 
 
 		 667 aa  53.9  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2757  fibronectin, type III  37.8 
 
 		 490 aa  52.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.48041  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5064  conserved repeat domain protein  37.36 
 
 		 853 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>