78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2630 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2630  fibronectin type III domain-containing protein  100 
 
 		 825 aa  1649    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3668  fibronectin type III domain-containing protein  43.5 
 
 		 836 aa  540  9.999999999999999e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2202  fibronectin type III domain-containing protein  36.61 
 
 		 841 aa  374  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536559 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3667  IPT/TIG domain-containing protein  40.33 
 
 		 448 aa  229  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2201  hypothetical protein  37.37 
 
 		 467 aa  218  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.283056 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2629  hypothetical protein  35.31 
 
 		 470 aa  207  9e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1844  IPT/TIG domain-containing protein  31.85 
 
 		 720 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138622  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2953  hypothetical protein  31.12 
 
 		 743 aa  158  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.143577  normal  0.387035 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1998  hypothetical protein  34.59 
 
 		 744 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.160392  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2552  hypothetical protein  35.58 
 
 		 743 aa  154  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0439698 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2366  hypothetical protein  33.51 
 
 		 743 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3397  hypothetical protein  33.96 
 
 		 755 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.748182 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1999  hypothetical protein  29.34 
 
 		 448 aa  140  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.71064  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2952  hypothetical protein  30.06 
 
 		 442 aa  119  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.302716  normal  0.304759 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3396  hypothetical protein  33.16 
 
 		 442 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.378832  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2367  hypothetical protein  33.16 
 
 		 442 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.390039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2553  hypothetical protein  32.65 
 
 		 442 aa  104  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475341 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  28.36 
 
 		 480 aa  86.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  28.53 
 
 		 2170 aa  75.9  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  35.85 
 
 		 648 aa  65.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  30.43 
 
 		 1363 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  27.58 
 
 		 6885 aa  63.2  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  29.89 
 
 		 455 aa  58.2  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  28.74 
 
 		 455 aa  57  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  28.74 
 
 		 455 aa  57  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  31.3 
 
 		 1380 aa  57.4  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  33.14 
 
 		 743 aa  57.4  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  28.74 
 
 		 455 aa  57  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  27.22 
 
 		 1042 aa  57  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  31.4 
 
 		 455 aa  56.2  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  29.35 
 
 		 455 aa  55.8  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  28.26 
 
 		 455 aa  55.1  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  28.26 
 
 		 455 aa  55.1  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  27.96 
 
 		 455 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  31.43 
 
 		 1363 aa  53.5  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2285  glycoside hydrolase family 16  33.55 
 
 		 539 aa  53.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0517847  hitchhiker  0.00991437 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  28.26 
 
 		 455 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  26.69 
 
 		 2068 aa  52.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  35.44 
 
 		 492 aa  51.6  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.381426  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2065  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  44.33 
 
 		 506 aa  51.6  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.140778  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2417  Fibronectin type III domain protein  34.26 
 
 		 485 aa  51.2  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  31.9 
 
 		 2286 aa  50.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  26.94 
 
 		 458 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  36.94 
 
 		 3507 aa  49.7  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  32.14 
 
 		 1160 aa  50.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1040  fibronectin type III domain-containing protein  23.96 
 
 		 771 aa  49.3  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0274  S-layer domain protein  26.17 
 
 		 779 aa  49.7  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.430281  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  32.76 
 
 		 456 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  28.83 
 
 		 455 aa  48.5  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  26.74 
 
 		 4433 aa  48.1  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  24.24 
 
 		 527 aa  48.1  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  31.82 
 
 		 1550 aa  47.8  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  26.64 
 
 		 680 aa  48.1  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  30.32 
 
 		 3027 aa  47.8  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  27.38 
 
 		 918 aa  47.8  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.67 
 
 		 1448 aa  47  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  36.56 
 
 		 703 aa  47.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1223  glycoside hydrolase family protein  29.76 
 
 		 484 aa  47  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0824686  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  35.09 
 
 		 2334 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  27.97 
 
 		 445 aa  45.8  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2757  fibronectin, type III  28.57 
 
 		 490 aa  45.8  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.48041  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  28.26 
 
 		 3802 aa  45.8  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 		 1121 aa  46.2  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  33.49 
 
 		 680 aa  45.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  44.83 
 
 		 608 aa  44.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1342  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase precursor  32.17 
 
 		 492 aa  44.7  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.968046  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  29.63 
 
 		 1462 aa  44.7  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0529  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  32.17 
 
 		 492 aa  44.7  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1547  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  32.17 
 
 		 492 aa  44.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1570  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase precursor  32.17 
 
 		 492 aa  44.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0624  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase precursor  32.17 
 
 		 492 aa  44.7  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.520528  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1740  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  32.17 
 
 		 492 aa  44.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.548806  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1543  cellulosome anchoring protein cohesin region  33.78 
 
 		 782 aa  44.7  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000430269  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0824  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  32.17 
 
 		 492 aa  44.7  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0168099  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0774  hypothetical protein  28.7 
 
 		 922 aa  44.3  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.891032 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  28.38 
 
 		 9585 aa  44.3  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  28.65 
 
 		 459 aa  44.3  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  35.62 
 
 		 561 aa  44.3  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>