143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2065 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2065  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  100 
 
 		 506 aa  1021    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.140778  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2417  Fibronectin type III domain protein  50.72 
 
 		 485 aa  434  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1238  fibronectin, type III domain-containing protein  49.18 
 
 		 485 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.109718  normal  0.858985 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07987  polyhydroxybutyrate depolymerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03560)  43.6 
 
 		 377 aa  263  4.999999999999999e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.445833  normal  0.346264 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3159  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  40.74 
 
 		 340 aa  243  7.999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2068  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  42.41 
 
 		 358 aa  236  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.151389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0127  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  39.46 
 
 		 347 aa  233  7.000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2303  polyhydroxybutyrate depolymerase  38.36 
 
 		 348 aa  212  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0176  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  34.47 
 
 		 375 aa  208  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02265  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  36.95 
 
 		 353 aa  206  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4785  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  34.5 
 
 		 374 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1977  polyhydroxybutyrate depolymerase  35.11 
 
 		 369 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2280  hypothetical protein  38.82 
 
 		 341 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70217  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2089  polyhydroxybutyrate depolymerase  38.82 
 
 		 341 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2146  polyhydroxybutyrate depolymerase  38.82 
 
 		 341 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.286329  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4259  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  34.64 
 
 		 322 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00982049 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34710  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase protein  33.43 
 
 		 338 aa  186  7e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.222008  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1585  putative depolymerase  34.07 
 
 		 362 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0731101  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1082  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  34.29 
 
 		 352 aa  174  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0665  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  32.4 
 
 		 355 aa  172  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.097547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5328  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  35.78 
 
 		 317 aa  172  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2373  fibronectin, type III domain-containing protein  34.33 
 
 		 385 aa  169  9e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5512  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  29.95 
 
 		 387 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.292347 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4772  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  30.14 
 
 		 356 aa  156  7e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.826591 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  55.03 
 
 		 492 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.381426  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0824  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  54.73 
 
 		 492 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0168099  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1740  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  54.73 
 
 		 492 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.548806  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1342  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase precursor  54.73 
 
 		 492 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.968046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0529  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  54.73 
 
 		 492 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0624  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase precursor  54.73 
 
 		 492 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.520528  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1547  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  54.73 
 
 		 492 aa  134  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1570  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase precursor  54.73 
 
 		 492 aa  134  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5556  putative depolymerase  26.68 
 
 		 403 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1647  putative depolymerase  26.26 
 
 		 391 aa  99.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543513  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4864  putative depolymerase  28.61 
 
 		 404 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3290  esterase, PHB depolymerase family  71.43 
 
 		 450 aa  83.2  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3289  PHB depolymerase family esterase  66.67 
 
 		 683 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0658  PHB depolymerase family esterase  64.91 
 
 		 683 aa  77  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.726264 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2179  esterase, PHB depolymerase family  57.89 
 
 		 419 aa  75.1  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0048  esterase, PHB depolymerase family  56.6 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  53.85 
 
 		 648 aa  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  48.86 
 
 		 649 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  43.48 
 
 		 1160 aa  62  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  46.34 
 
 		 1121 aa  57.8  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  41.41 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  46.91 
 
 		 1209 aa  57.8  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  38.71 
 
 		 1401 aa  57.8  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  38.38 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  46.91 
 
 		 1137 aa  57.4  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  36.36 
 
 		 455 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  43.53 
 
 		 743 aa  57  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  39.17 
 
 		 445 aa  56.6  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  41.57 
 
 		 6885 aa  56.2  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  38.3 
 
 		 455 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0082  esterase, PHB depolymerase  44.23 
 
 		 414 aa  55.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  38.3 
 
 		 455 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  32.31 
 
 		 455 aa  55.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  36.45 
 
 		 455 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  38.38 
 
 		 455 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2773  fibronectin, type III  44.87 
 
 		 1115 aa  54.3  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5622  fibronectin type III domain-containing protein  27.89 
 
 		 660 aa  54.3  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  31.15 
 
 		 455 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5623  fibronectin type III domain-containing protein  28.99 
 
 		 749 aa  53.9  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.198115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  42.27 
 
 		 614 aa  53.9  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  39.81 
 
 		 703 aa  53.9  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  31.97 
 
 		 455 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  42.86 
 
 		 809 aa  53.5  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  31.15 
 
 		 455 aa  53.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  43.16 
 
 		 762 aa  53.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  35.96 
 
 		 651 aa  53.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5472  fibronectin type III domain-containing protein  31.62 
 
 		 787 aa  53.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000573168  decreased coverage  0.000436266 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  28.95 
 
 		 459 aa  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  44.44 
 
 		 692 aa  52.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  37.37 
 
 		 456 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  33.33 
 
 		 598 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  35.87 
 
 		 1004 aa  51.6  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  41.41 
 
 		 552 aa  50.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  37.37 
 
 		 803 aa  50.4  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1601  fibronectin, type III  31.53 
 
 		 548 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.751366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  42.35 
 
 		 561 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4335  alpha amylase catalytic region  39.29 
 
 		 1753 aa  50.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.167512  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  37.86 
 
 		 2170 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  40.45 
 
 		 1307 aa  50.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.96 
 
 		 649 aa  49.7  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  39.77 
 
 		 795 aa  49.7  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0371  esterase, PHB depolymerase  29.85 
 
 		 394 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  38.24 
 
 		 667 aa  49.3  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  38.68 
 
 		 1887 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  34.91 
 
 		 458 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2285  glycoside hydrolase family 16  38.78 
 
 		 539 aa  48.9  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0517847  hitchhiker  0.00991437 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  34.21 
 
 		 456 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2949  chitinase  34.15 
 
 		 483 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  33.79 
 
 		 3027 aa  48.5  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  44.19 
 
 		 655 aa  48.1  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  35.71 
 
 		 1401 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  36.45 
 
 		 1154 aa  47.8  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2630  fibronectin type III domain-containing protein  45.68 
 
 		 825 aa  47.8  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3990  Poly (3-hydroxybutyrate ) depolymerase  31.13 
 
 		 396 aa  47.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  43.66 
 
 		 973 aa  47.4  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  33.33 
 
 		 3802 aa  47  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168147 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>