47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_2089 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_2089  polyhydroxybutyrate depolymerase  100 
 
 		 341 aa  684    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2280  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  684    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70217  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2146  polyhydroxybutyrate depolymerase  100 
 
 		 341 aa  684    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.286329  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2303  polyhydroxybutyrate depolymerase  93.44 
 
 		 348 aa  590  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3159  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  55.7 
 
 		 340 aa  365  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0127  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  54.29 
 
 		 347 aa  342  5e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2068  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  50.31 
 
 		 358 aa  297  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.151389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2417  Fibronectin type III domain protein  45.57 
 
 		 485 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4785  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  43.88 
 
 		 374 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1238  fibronectin, type III domain-containing protein  40.76 
 
 		 485 aa  239  6.999999999999999e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.109718  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4259  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  44.07 
 
 		 322 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00982049 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1977  polyhydroxybutyrate depolymerase  41.69 
 
 		 369 aa  233  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02265  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  39.77 
 
 		 353 aa  228  8e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34710  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase protein  40.92 
 
 		 338 aa  223  4.9999999999999996e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.222008  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0176  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  41.03 
 
 		 375 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1585  putative depolymerase  40.29 
 
 		 362 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0731101  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2065  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  38.08 
 
 		 506 aa  208  9e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.140778  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5512  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  38.1 
 
 		 387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.292347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5328  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  37.61 
 
 		 317 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4772  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  35.24 
 
 		 356 aa  192  7e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.826591 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0665  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  35.63 
 
 		 355 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.097547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1082  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  34.23 
 
 		 352 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2373  fibronectin, type III domain-containing protein  32.32 
 
 		 385 aa  149  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07987  polyhydroxybutyrate depolymerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03560)  32.46 
 
 		 377 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.445833  normal  0.346264 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5556  putative depolymerase  30.24 
 
 		 403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4864  putative depolymerase  31.03 
 
 		 404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1647  putative depolymerase  31.31 
 
 		 391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543513  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0048  esterase, PHB depolymerase family  33.33 
 
 		 417 aa  50.8  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616843 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2268  esterase, PHB depolymerase family  32.29 
 
 		 344 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493113  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2149  hypothetical protein  33 
 
 		 343 aa  50.1  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000536767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1945  esterase, PHB depolymerase family  33.33 
 
 		 344 aa  50.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.198099  normal  0.0353299 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7065  esterase, PHB depolymerase family  32.48 
 
 		 426 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.185362  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0535  esterase, PHB depolymerase family  39.22 
 
 		 338 aa  44.3  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.660761  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0493  esterase, PHB depolymerase family  31.08 
 
 		 378 aa  44.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5954  PHB depolymerase family esterase  33.78 
 
 		 438 aa  43.9  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.159743 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3172  esterase, PHB depolymerase family protein  32.61 
 
 		 300 aa  43.9  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0370898  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3290  esterase, PHB depolymerase family  33.33 
 
 		 450 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3660  PHB depolymerase family esterase  32 
 
 		 381 aa  43.5  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.741995  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5113  esterase, PHB depolymerase  29.91 
 
 		 370 aa  43.5  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3990  Poly (3-hydroxybutyrate ) depolymerase  33.33 
 
 		 396 aa  43.5  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1658  esterase, PHB depolymerase family  28.72 
 
 		 363 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.044626  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2065  esterase, PHB depolymerase  39.29 
 
 		 359 aa  43.5  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0523522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1658  hypothetical protein  29.11 
 
 		 342 aa  43.5  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32348  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2179  esterase, PHB depolymerase family  28.57 
 
 		 419 aa  43.1  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4749  esterase, PHB depolymerase family  32.43 
 
 		 343 aa  42.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  31.34 
 
 		 372 aa  42.7  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1940  PHB depolymerase family esterase  35.09 
 
 		 433 aa  42.7  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>