54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1082 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1082  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  100 
 
 		 352 aa  713    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5328  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  48.87 
 
 		 317 aa  300  3e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2417  Fibronectin type III domain protein  40.8 
 
 		 485 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0127  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  39.93 
 
 		 347 aa  214  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02265  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  36.17 
 
 		 353 aa  199  7e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1238  fibronectin, type III domain-containing protein  36.49 
 
 		 485 aa  193  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.109718  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3159  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  38.28 
 
 		 340 aa  193  4e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2373  fibronectin, type III domain-containing protein  37.61 
 
 		 385 aa  192  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1977  polyhydroxybutyrate depolymerase  32.13 
 
 		 369 aa  187  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1585  putative depolymerase  36.81 
 
 		 362 aa  182  6e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0731101  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07987  polyhydroxybutyrate depolymerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03560)  34.56 
 
 		 377 aa  177  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.445833  normal  0.346264 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0176  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  33.43 
 
 		 375 aa  173  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4785  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  34.62 
 
 		 374 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4259  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  34.82 
 
 		 322 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00982049 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2303  polyhydroxybutyrate depolymerase  35.95 
 
 		 348 aa  170  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2065  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  34.29 
 
 		 506 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.140778  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2146  polyhydroxybutyrate depolymerase  35.29 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.286329  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2280  hypothetical protein  35.29 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70217  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2089  polyhydroxybutyrate depolymerase  35.29 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2068  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  31.78 
 
 		 358 aa  155  9e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.151389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4772  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  31.85 
 
 		 356 aa  155  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.826591 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5512  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  32.65 
 
 		 387 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.292347 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0665  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  31.16 
 
 		 355 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.097547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34710  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase protein  28.17 
 
 		 338 aa  143  6e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.222008  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5556  putative depolymerase  27.59 
 
 		 403 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4864  putative depolymerase  26.68 
 
 		 404 aa  99.4  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1647  putative depolymerase  25 
 
 		 391 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543513  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  39.71 
 
 		 372 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2770  PHB depolymerase family esterase  38.24 
 
 		 544 aa  50.8  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  37.14 
 
 		 312 aa  50.1  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1940  PHB depolymerase family esterase  35.11 
 
 		 433 aa  49.7  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0535  esterase, PHB depolymerase family  33.82 
 
 		 338 aa  48.9  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.660761  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4502  esterase, PHB depolymerase  30.16 
 
 		 365 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42248  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3665  PHB depolymerase family esterase  30.16 
 
 		 365 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.131134  normal  0.75521 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3862  PHB depolymerase family esterase  30.16 
 
 		 365 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0810078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2234  esterase, PHB depolymerase  30.95 
 
 		 369 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111052  normal  0.321017 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3759  PHB depolymerase family esterase  30.85 
 
 		 369 aa  47  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209534 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3230  PHB depolymerase family esterase  30.85 
 
 		 369 aa  47  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.891696  normal  0.152859 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  37.31 
 
 		 334 aa  45.8  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4883  PHB depolymerase family esterase  33.33 
 
 		 369 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103512  hitchhiker  0.0011428 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4102  hypothetical protein  35.29 
 
 		 385 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.943667 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6240  PHB depolymerase family esterase  38.24 
 
 		 466 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.721378 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4273  esterase, PHB depolymerase  35.29 
 
 		 394 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2846  esterase, PHB depolymerase  30.85 
 
 		 398 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  38.24 
 
 		 429 aa  45.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2059  phospholipase/carboxylesterase  35.29 
 
 		 343 aa  44.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.550035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2576  esterase, PHB depolymerase  35.71 
 
 		 396 aa  44.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.225739  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0595  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  35.11 
 
 		 364 aa  44.3  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3990  Poly (3-hydroxybutyrate ) depolymerase  32.32 
 
 		 396 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4407  PHB depolymerase family esterase  30.86 
 
 		 398 aa  43.9  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.32684  normal  0.707171 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6802  esterase, PHB depolymerase family  30.86 
 
 		 398 aa  43.9  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0419644  decreased coverage  0.000000125026 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7065  esterase, PHB depolymerase family  36.76 
 
 		 426 aa  43.5  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.185362  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3344  PHB depolymerase family esterase  36.76 
 
 		 429 aa  42.7  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.335799  normal  0.68562 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4018  hypothetical protein  30.48 
 
 		 355 aa  43.1  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>