177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3344 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3344  PHB depolymerase family esterase  100 
 
 
429 aa  874    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.335799  normal  0.68562 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5706  PHB depolymerase family esterase  50.22 
 
 
438 aa  384  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137114  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3360  esterase, PHB depolymerase family  51.61 
 
 
419 aa  377  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.995755 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4127  esterase, PHB depolymerase family  53.01 
 
 
419 aa  375  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3819  PHB depolymerase family esterase  53.01 
 
 
419 aa  374  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  45.63 
 
 
429 aa  349  7e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3867  esterase, PHB depolymerase  48.38 
 
 
404 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.10201  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6025  PHB depolymerase family esterase  51.72 
 
 
416 aa  333  5e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950963  normal  0.103792 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4273  esterase, PHB depolymerase  49.42 
 
 
394 aa  332  7.000000000000001e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5379  putative esterase, PHB depolymerase  60 
 
 
411 aa  323  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.449035 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3857  PHB depolymerase family esterase  51.61 
 
 
414 aa  308  2.0000000000000002e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  55.1 
 
 
372 aa  306  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  53.58 
 
 
367 aa  306  6e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  51.36 
 
 
312 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6240  PHB depolymerase family esterase  53.27 
 
 
466 aa  302  9e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.721378 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2991  PHB depolymerase family esterase  54.45 
 
 
419 aa  300  3e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2650  hypothetical protein  52.19 
 
 
355 aa  299  8e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376354  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7065  esterase, PHB depolymerase family  55.59 
 
 
426 aa  298  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.185362  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2065  esterase, PHB depolymerase  52.23 
 
 
359 aa  290  3e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0523522  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1484  esterase, PHB depolymerase family  45.63 
 
 
425 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220911  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1969  esterase, PHB depolymerase  46.27 
 
 
373 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.127109  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4027  PHB depolymerase family esterase  50.52 
 
 
387 aa  280  3e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1761  esterase, PHB depolymerase family  43.75 
 
 
422 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.496023 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2576  esterase, PHB depolymerase  47.52 
 
 
396 aa  273  6e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.225739  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2204  esterase, PHB depolymerase  50 
 
 
367 aa  272  1e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.667331  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1483  PHB depolymerase family esterase  43.71 
 
 
422 aa  271  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0485134  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1173  esterase, PHB depolymerase family  52.76 
 
 
410 aa  265  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4281  PHB depolymerase family esterase  43.5 
 
 
403 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0631571 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4102  hypothetical protein  51.05 
 
 
385 aa  259  8e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.943667 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3990  Poly (3-hydroxybutyrate ) depolymerase  47.19 
 
 
396 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1990  esterase, PHB depolymerase family  49.31 
 
 
406 aa  258  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000642829  normal  0.085302 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1984  esterase, PHB depolymerase family  50 
 
 
337 aa  245  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000502853  normal  0.034342 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2770  PHB depolymerase family esterase  44.98 
 
 
544 aa  238  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0209  esterase, PHB depolymerase family  47.52 
 
 
342 aa  224  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4615  PHB depolymerase family esterase  43.15 
 
 
359 aa  207  4e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0493  esterase, PHB depolymerase family  39.47 
 
 
378 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  37.41 
 
 
334 aa  189  9e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2820  esterase, PHB depolymerase family  37.46 
 
 
352 aa  173  5.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000611867  hitchhiker  0.00921779 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4883  PHB depolymerase family esterase  37.18 
 
 
369 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103512  hitchhiker  0.0011428 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4018  hypothetical protein  37.46 
 
 
355 aa  165  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4407  PHB depolymerase family esterase  35.79 
 
 
398 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.32684  normal  0.707171 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4502  esterase, PHB depolymerase  37.86 
 
 
365 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42248  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3862  PHB depolymerase family esterase  37.86 
 
 
365 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0810078  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3665  PHB depolymerase family esterase  37.86 
 
 
365 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.131134  normal  0.75521 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2846  esterase, PHB depolymerase  33.8 
 
 
398 aa  160  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222858  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2268  esterase, PHB depolymerase family  37.33 
 
 
344 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493113  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6802  esterase, PHB depolymerase family  33.92 
 
 
398 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0419644  decreased coverage  0.000000125026 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2234  esterase, PHB depolymerase  37.14 
 
 
369 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111052  normal  0.321017 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2059  phospholipase/carboxylesterase  35.56 
 
 
343 aa  154  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.550035  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1945  esterase, PHB depolymerase family  37.88 
 
 
344 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.198099  normal  0.0353299 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0595  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  35.74 
 
 
364 aa  153  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0301  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  35.74 
 
 
367 aa  152  8e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0865  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  35.74 
 
 
367 aa  152  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208532  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1480  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  35.74 
 
 
382 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289263  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1676  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  35.74 
 
 
382 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.254076  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2562  depolymerase  35.74 
 
 
382 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2425  PHB depolymerase family esterase  35.74 
 
 
382 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0332  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  35.74 
 
 
364 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203676  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9052  polyhydroxybutyrate depolymerase  34.46 
 
 
366 aa  151  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2149  hypothetical protein  34.04 
 
 
343 aa  150  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000536767  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3626  esterase, PHB depolymerase  39.15 
 
 
362 aa  150  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155827  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3759  PHB depolymerase family esterase  38.65 
 
 
369 aa  149  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209534 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3230  PHB depolymerase family esterase  38.3 
 
 
369 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.891696  normal  0.152859 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1940  PHB depolymerase family esterase  35.34 
 
 
433 aa  145  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0535  esterase, PHB depolymerase family  36.59 
 
 
338 aa  144  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.660761  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3949  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  35.46 
 
 
357 aa  143  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.994388 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4749  esterase, PHB depolymerase family  39.29 
 
 
343 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3823  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  33.44 
 
 
374 aa  137  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1012  polyhydroxyalkanoate depolymerase domain-containing protein  34.18 
 
 
427 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5113  esterase, PHB depolymerase  32.18 
 
 
370 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4602  esterase, PHB depolymerase  32.59 
 
 
317 aa  134  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2179  esterase, PHB depolymerase family  33.59 
 
 
419 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0371  esterase, PHB depolymerase  33.33 
 
 
394 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2235  polyhydroxyalkanoate depolymerase domain-containing protein  33.82 
 
 
427 aa  133  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00861555  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2039  PHB depolymerase family esterase  34.48 
 
 
362 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.249198  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2094  PHB depolymerase family esterase  34.48 
 
 
362 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4301  PHB depolymerase family esterase  35 
 
 
368 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7674  putative polyhydroxy-alkanoate/butyrate(PHA/PHB) depolymerase  36.57 
 
 
529 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5982  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  31.65 
 
 
358 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221901  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3660  PHB depolymerase family esterase  35.55 
 
 
381 aa  125  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.741995  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0568  esterase, PHB depolymerase family  30.39 
 
 
395 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6278  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  32.37 
 
 
358 aa  124  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7221  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  33.21 
 
 
363 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201442  normal  0.80823 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0048  esterase, PHB depolymerase family  32.95 
 
 
417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616843 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1463  esterase, PHB depolymerase family  32.26 
 
 
363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0308241  normal  0.241375 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0711  esterase, PHB depolymerase  28.53 
 
 
392 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.612274  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0137  esterase, PHB depolymerase  34.62 
 
 
392 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5954  PHB depolymerase family esterase  32.46 
 
 
438 aa  111  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.159743 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3290  esterase, PHB depolymerase family  30.12 
 
 
450 aa  109  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195473  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5573  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  31.18 
 
 
421 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.95415  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5937  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  31.18 
 
 
421 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6439  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  32 
 
 
445 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1658  hypothetical protein  34.83 
 
 
342 aa  107  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32348  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31730  esterase, PHB depolymerase family  29.55 
 
 
331 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0082  esterase, PHB depolymerase  28.79 
 
 
414 aa  102  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1658  esterase, PHB depolymerase family  32.93 
 
 
363 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.044626  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0935  putative polyhydroxyalkanoate depolymerase  31.75 
 
 
343 aa  99.4  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0520  putative polyhydroxyalkanoate depolymerase  34.11 
 
 
315 aa  95.5  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.213794 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3457  PHB depolymerase family esterase  31.38 
 
 
308 aa  90.9  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00100534  normal  0.0484591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0666  PHB depolymerase family esterase  31.38 
 
 
308 aa  90.5  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.19814 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>