165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4102 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4102  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  760    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.943667 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3990  Poly (3-hydroxybutyrate ) depolymerase  59.3 
 
 		 396 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2991  PHB depolymerase family esterase  46.34 
 
 		 419 aa  321  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2204  esterase, PHB depolymerase  53.5 
 
 		 367 aa  286  2.9999999999999996e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.667331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  50.88 
 
 		 312 aa  278  9e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  49.66 
 
 		 429 aa  273  5.000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  42.46 
 
 		 367 aa  272  6e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  43.51 
 
 		 372 aa  272  9e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3344  PHB depolymerase family esterase  49.83 
 
 		 429 aa  269  5e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.335799  normal  0.68562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4127  esterase, PHB depolymerase family  42.57 
 
 		 419 aa  266  5e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3819  PHB depolymerase family esterase  42.82 
 
 		 419 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4273  esterase, PHB depolymerase  49.66 
 
 		 394 aa  261  1e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6025  PHB depolymerase family esterase  48.62 
 
 		 416 aa  261  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950963  normal  0.103792 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3857  PHB depolymerase family esterase  46.9 
 
 		 414 aa  256  5e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5706  PHB depolymerase family esterase  48.65 
 
 		 438 aa  256  5e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137114  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2650  hypothetical protein  51.09 
 
 		 355 aa  255  8e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7065  esterase, PHB depolymerase family  56.3 
 
 		 426 aa  255  9e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.185362  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2065  esterase, PHB depolymerase  48.23 
 
 		 359 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0523522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4027  PHB depolymerase family esterase  44.47 
 
 		 387 aa  251  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1483  PHB depolymerase family esterase  43.27 
 
 		 422 aa  247  3e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0485134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6240  PHB depolymerase family esterase  54.41 
 
 		 466 aa  246  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.721378 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1969  esterase, PHB depolymerase  45.62 
 
 		 373 aa  246  4e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.127109  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5379  putative esterase, PHB depolymerase  50.86 
 
 		 411 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.449035 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1761  esterase, PHB depolymerase family  42.86 
 
 		 422 aa  243  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.496023 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3867  esterase, PHB depolymerase  44.13 
 
 		 404 aa  243  3e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.10201  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1990  esterase, PHB depolymerase family  49.81 
 
 		 406 aa  242  7.999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000642829  normal  0.085302 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1484  esterase, PHB depolymerase family  47.37 
 
 		 425 aa  239  5e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220911  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2576  esterase, PHB depolymerase  46.83 
 
 		 396 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.225739  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3360  esterase, PHB depolymerase family  48.23 
 
 		 419 aa  238  1e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.995755 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1984  esterase, PHB depolymerase family  48.12 
 
 		 337 aa  211  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000502853  normal  0.034342 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1173  esterase, PHB depolymerase family  48.88 
 
 		 410 aa  211  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4281  PHB depolymerase family esterase  45.99 
 
 		 403 aa  205  8e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0631571 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0209  esterase, PHB depolymerase family  43.84 
 
 		 342 aa  194  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0493  esterase, PHB depolymerase family  42.4 
 
 		 378 aa  194  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2770  PHB depolymerase family esterase  36.86 
 
 		 544 aa  183  5.0000000000000004e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4407  PHB depolymerase family esterase  35 
 
 		 398 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.32684  normal  0.707171 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2820  esterase, PHB depolymerase family  36.84 
 
 		 352 aa  160  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000611867  hitchhiker  0.00921779 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2846  esterase, PHB depolymerase  37.32 
 
 		 398 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2059  phospholipase/carboxylesterase  39.19 
 
 		 343 aa  156  7e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.550035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6802  esterase, PHB depolymerase family  36.96 
 
 		 398 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0419644  decreased coverage  0.000000125026 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4018  hypothetical protein  41.99 
 
 		 355 aa  154  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4502  esterase, PHB depolymerase  37.45 
 
 		 365 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42248  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3862  PHB depolymerase family esterase  37.45 
 
 		 365 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0810078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3665  PHB depolymerase family esterase  37.45 
 
 		 365 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.131134  normal  0.75521 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  32.99 
 
 		 334 aa  152  8e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4883  PHB depolymerase family esterase  37.45 
 
 		 369 aa  150  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103512  hitchhiker  0.0011428 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0595  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  37.18 
 
 		 364 aa  150  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4615  PHB depolymerase family esterase  43.42 
 
 		 359 aa  150  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3626  esterase, PHB depolymerase  42.45 
 
 		 362 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155827  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2234  esterase, PHB depolymerase  37.09 
 
 		 369 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111052  normal  0.321017 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5113  esterase, PHB depolymerase  38.79 
 
 		 370 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0301  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  37.05 
 
 		 367 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0865  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  37.05 
 
 		 367 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208532  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1480  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  37.05 
 
 		 382 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289263  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1676  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  37.05 
 
 		 382 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.254076  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2562  depolymerase  37.05 
 
 		 382 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2425  PHB depolymerase family esterase  37.05 
 
 		 382 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0332  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  37.05 
 
 		 364 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203676  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0568  esterase, PHB depolymerase family  32.01 
 
 		 395 aa  143  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3949  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  40.81 
 
 		 357 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.994388 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4749  esterase, PHB depolymerase family  33.11 
 
 		 343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1945  esterase, PHB depolymerase family  34.55 
 
 		 344 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.198099  normal  0.0353299 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3823  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  37.1 
 
 		 374 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9052  polyhydroxybutyrate depolymerase  33.85 
 
 		 366 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1940  PHB depolymerase family esterase  36.92 
 
 		 433 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2268  esterase, PHB depolymerase family  34.55 
 
 		 344 aa  139  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4602  esterase, PHB depolymerase  37.05 
 
 		 317 aa  139  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3759  PHB depolymerase family esterase  38.91 
 
 		 369 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209534 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3230  PHB depolymerase family esterase  38.91 
 
 		 369 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.891696  normal  0.152859 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1463  esterase, PHB depolymerase family  32.2 
 
 		 363 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0308241  normal  0.241375 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0371  esterase, PHB depolymerase  38.83 
 
 		 394 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7674  putative polyhydroxy-alkanoate/butyrate(PHA/PHB) depolymerase  31.72 
 
 		 529 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0535  esterase, PHB depolymerase family  36.46 
 
 		 338 aa  129  8.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.660761  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0137  esterase, PHB depolymerase  35 
 
 		 392 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2149  hypothetical protein  34.91 
 
 		 343 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000536767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3660  PHB depolymerase family esterase  31.76 
 
 		 381 aa  126  6e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.741995  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0048  esterase, PHB depolymerase family  37.44 
 
 		 417 aa  122  8e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616843 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0711  esterase, PHB depolymerase  32.22 
 
 		 392 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.612274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4301  PHB depolymerase family esterase  37.55 
 
 		 368 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2179  esterase, PHB depolymerase family  32.14 
 
 		 419 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0082  esterase, PHB depolymerase  29.31 
 
 		 414 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6278  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  34.06 
 
 		 358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5982  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  33.21 
 
 		 358 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221901  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1012  polyhydroxyalkanoate depolymerase domain-containing protein  33.94 
 
 		 427 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2235  polyhydroxyalkanoate depolymerase domain-containing protein  33.94 
 
 		 427 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00861555  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7221  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  35.42 
 
 		 363 aa  110  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201442  normal  0.80823 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5573  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  35.66 
 
 		 421 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.95415  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5937  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  35.66 
 
 		 421 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0935  putative polyhydroxyalkanoate depolymerase  30.48 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6439  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  34.77 
 
 		 445 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1658  hypothetical protein  33.92 
 
 		 342 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32348  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1658  esterase, PHB depolymerase family  33.33 
 
 		 363 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.044626  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2039  PHB depolymerase family esterase  33.85 
 
 		 362 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.249198  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2094  PHB depolymerase family esterase  33.85 
 
 		 362 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5954  PHB depolymerase family esterase  35.93 
 
 		 438 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.159743 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31730  esterase, PHB depolymerase family  29.39 
 
 		 331 aa  103  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3290  esterase, PHB depolymerase family  29.71 
 
 		 450 aa  102  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3146  PHB depolymerase family esterase  36.87 
 
 		 308 aa  95.9  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.616621  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3195  PHB depolymerase family esterase  36.87 
 
 		 308 aa  95.9  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0520  putative polyhydroxyalkanoate depolymerase  29.64 
 
 		 315 aa  95.1  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.213794 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>