195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5706 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5706  PHB depolymerase family esterase  100 
 
 
438 aa  877    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137114  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3360  esterase, PHB depolymerase family  65.38 
 
 
419 aa  544  1e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.995755 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3819  PHB depolymerase family esterase  65.12 
 
 
419 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4127  esterase, PHB depolymerase family  64.5 
 
 
419 aa  511  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3344  PHB depolymerase family esterase  49.89 
 
 
429 aa  393  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.335799  normal  0.68562 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6025  PHB depolymerase family esterase  60.34 
 
 
416 aa  388  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950963  normal  0.103792 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  48.33 
 
 
429 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3867  esterase, PHB depolymerase  51.7 
 
 
404 aa  365  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.10201  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4273  esterase, PHB depolymerase  51.99 
 
 
394 aa  346  4e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5379  putative esterase, PHB depolymerase  51.88 
 
 
411 aa  344  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.449035 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  58.12 
 
 
367 aa  323  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  57.45 
 
 
372 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7065  esterase, PHB depolymerase family  58.25 
 
 
426 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.185362  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2991  PHB depolymerase family esterase  48.33 
 
 
419 aa  310  5e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  56.45 
 
 
312 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2650  hypothetical protein  55.44 
 
 
355 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376354  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2065  esterase, PHB depolymerase  56.79 
 
 
359 aa  302  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0523522  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1969  esterase, PHB depolymerase  59.86 
 
 
373 aa  300  2e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.127109  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3857  PHB depolymerase family esterase  53.45 
 
 
414 aa  299  7e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6240  PHB depolymerase family esterase  59.51 
 
 
466 aa  298  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.721378 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1761  esterase, PHB depolymerase family  47.07 
 
 
422 aa  297  3e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.496023 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1484  esterase, PHB depolymerase family  46.64 
 
 
425 aa  296  7e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220911  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1483  PHB depolymerase family esterase  45.76 
 
 
422 aa  294  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0485134  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1990  esterase, PHB depolymerase family  53.41 
 
 
406 aa  288  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000642829  normal  0.085302 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2576  esterase, PHB depolymerase  47.53 
 
 
396 aa  279  8e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.225739  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2204  esterase, PHB depolymerase  51.06 
 
 
367 aa  278  2e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.667331  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4281  PHB depolymerase family esterase  54.42 
 
 
403 aa  276  4e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0631571 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4027  PHB depolymerase family esterase  51.7 
 
 
387 aa  274  3e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3990  Poly (3-hydroxybutyrate ) depolymerase  51.79 
 
 
396 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1173  esterase, PHB depolymerase family  53.74 
 
 
410 aa  265  8.999999999999999e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1984  esterase, PHB depolymerase family  53.85 
 
 
337 aa  264  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000502853  normal  0.034342 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4102  hypothetical protein  51.09 
 
 
385 aa  259  9e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.943667 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2770  PHB depolymerase family esterase  44.67 
 
 
544 aa  246  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0209  esterase, PHB depolymerase family  47.96 
 
 
342 aa  218  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0493  esterase, PHB depolymerase family  41.55 
 
 
378 aa  217  4e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  39.39 
 
 
334 aa  205  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4615  PHB depolymerase family esterase  48.26 
 
 
359 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2820  esterase, PHB depolymerase family  38.8 
 
 
352 aa  192  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000611867  hitchhiker  0.00921779 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2846  esterase, PHB depolymerase  36.48 
 
 
398 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222858  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6802  esterase, PHB depolymerase family  36.48 
 
 
398 aa  183  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0419644  decreased coverage  0.000000125026 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4883  PHB depolymerase family esterase  39.58 
 
 
369 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103512  hitchhiker  0.0011428 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4407  PHB depolymerase family esterase  35.99 
 
 
398 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.32684  normal  0.707171 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4502  esterase, PHB depolymerase  38.87 
 
 
365 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42248  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3665  PHB depolymerase family esterase  38.87 
 
 
365 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.131134  normal  0.75521 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3862  PHB depolymerase family esterase  38.87 
 
 
365 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0810078  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2234  esterase, PHB depolymerase  39.22 
 
 
369 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111052  normal  0.321017 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3949  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  40.28 
 
 
357 aa  171  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.994388 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3626  esterase, PHB depolymerase  40.36 
 
 
362 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155827  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2149  hypothetical protein  36.14 
 
 
343 aa  164  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000536767  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0301  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  36.9 
 
 
367 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0865  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  36.9 
 
 
367 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208532  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0595  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  37.07 
 
 
364 aa  164  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1480  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  36.73 
 
 
382 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289263  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1676  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  36.73 
 
 
382 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.254076  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2562  depolymerase  36.73 
 
 
382 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2425  PHB depolymerase family esterase  36.73 
 
 
382 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0332  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  36.9 
 
 
364 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203676  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4018  hypothetical protein  38.55 
 
 
355 aa  159  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2268  esterase, PHB depolymerase family  36.51 
 
 
344 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493113  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1945  esterase, PHB depolymerase family  37.21 
 
 
344 aa  153  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.198099  normal  0.0353299 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2059  phospholipase/carboxylesterase  35.34 
 
 
343 aa  153  8e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.550035  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3230  PHB depolymerase family esterase  39.58 
 
 
369 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.891696  normal  0.152859 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3759  PHB depolymerase family esterase  39.58 
 
 
369 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209534 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1940  PHB depolymerase family esterase  35.89 
 
 
433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0535  esterase, PHB depolymerase family  38.2 
 
 
338 aa  145  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.660761  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9052  polyhydroxybutyrate depolymerase  34.6 
 
 
366 aa  144  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4602  esterase, PHB depolymerase  36.32 
 
 
317 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4301  PHB depolymerase family esterase  37.21 
 
 
368 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1012  polyhydroxyalkanoate depolymerase domain-containing protein  34.67 
 
 
427 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2039  PHB depolymerase family esterase  35.77 
 
 
362 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.249198  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2094  PHB depolymerase family esterase  35.77 
 
 
362 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4749  esterase, PHB depolymerase family  35.8 
 
 
343 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2235  polyhydroxyalkanoate depolymerase domain-containing protein  34.31 
 
 
427 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00861555  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3823  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  34.29 
 
 
374 aa  137  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5113  esterase, PHB depolymerase  36.43 
 
 
370 aa  136  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2179  esterase, PHB depolymerase family  34.36 
 
 
419 aa  134  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0371  esterase, PHB depolymerase  33.57 
 
 
394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7221  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  35.04 
 
 
363 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201442  normal  0.80823 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6278  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  35.4 
 
 
358 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5982  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  34.67 
 
 
358 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221901  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1463  esterase, PHB depolymerase family  32.65 
 
 
363 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0308241  normal  0.241375 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0568  esterase, PHB depolymerase family  31.53 
 
 
395 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3660  PHB depolymerase family esterase  31.83 
 
 
381 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.741995  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0048  esterase, PHB depolymerase family  35.25 
 
 
417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616843 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31730  esterase, PHB depolymerase family  33.47 
 
 
331 aa  127  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7674  putative polyhydroxy-alkanoate/butyrate(PHA/PHB) depolymerase  34.22 
 
 
529 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0711  esterase, PHB depolymerase  31.38 
 
 
392 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.612274  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5954  PHB depolymerase family esterase  33.21 
 
 
438 aa  119  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.159743 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6439  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  33.21 
 
 
445 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5573  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  33.09 
 
 
421 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.95415  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5937  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  33.09 
 
 
421 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0082  esterase, PHB depolymerase  30.82 
 
 
414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0137  esterase, PHB depolymerase  34.62 
 
 
392 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3290  esterase, PHB depolymerase family  29.08 
 
 
450 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195473  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1658  esterase, PHB depolymerase family  34.12 
 
 
363 aa  107  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.044626  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0935  putative polyhydroxyalkanoate depolymerase  32.02 
 
 
343 aa  104  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1658  hypothetical protein  34.24 
 
 
342 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32348  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3146  PHB depolymerase family esterase  34.95 
 
 
308 aa  93.2  9e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.616621  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3195  PHB depolymerase family esterase  34.95 
 
 
308 aa  93.2  9e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0666  PHB depolymerase family esterase  32.76 
 
 
308 aa  89.4  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.19814 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>