185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2268 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1945  esterase, PHB depolymerase family  98.26 
 
 
344 aa  687    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.198099  normal  0.0353299 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2268  esterase, PHB depolymerase family  100 
 
 
344 aa  702    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493113  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2149  hypothetical protein  79.18 
 
 
343 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000536767  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6802  esterase, PHB depolymerase family  43.52 
 
 
398 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0419644  decreased coverage  0.000000125026 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4883  PHB depolymerase family esterase  47.28 
 
 
369 aa  263  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103512  hitchhiker  0.0011428 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4502  esterase, PHB depolymerase  47.6 
 
 
365 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42248  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3665  PHB depolymerase family esterase  47.6 
 
 
365 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.131134  normal  0.75521 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3862  PHB depolymerase family esterase  47.6 
 
 
365 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0810078  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2846  esterase, PHB depolymerase  42.94 
 
 
398 aa  259  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222858  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4407  PHB depolymerase family esterase  43.94 
 
 
398 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.32684  normal  0.707171 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2234  esterase, PHB depolymerase  47.28 
 
 
369 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111052  normal  0.321017 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1480  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  45.39 
 
 
382 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289263  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1676  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  45.39 
 
 
382 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.254076  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2562  depolymerase  45.39 
 
 
382 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2425  PHB depolymerase family esterase  45.39 
 
 
382 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0301  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  45.39 
 
 
367 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0865  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  45.39 
 
 
367 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208532  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0332  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  45.39 
 
 
364 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203676  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3230  PHB depolymerase family esterase  47.6 
 
 
369 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.891696  normal  0.152859 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3759  PHB depolymerase family esterase  47.6 
 
 
369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209534 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0595  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  43.61 
 
 
364 aa  229  6e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7221  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  43.37 
 
 
363 aa  206  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201442  normal  0.80823 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5982  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  44.98 
 
 
358 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221901  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6278  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  43.14 
 
 
358 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2235  polyhydroxyalkanoate depolymerase domain-containing protein  41.1 
 
 
427 aa  198  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00861555  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1012  polyhydroxyalkanoate depolymerase domain-containing protein  41.1 
 
 
427 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5573  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  45.68 
 
 
421 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.95415  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5937  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  45.68 
 
 
421 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2094  PHB depolymerase family esterase  44.66 
 
 
362 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2039  PHB depolymerase family esterase  44.66 
 
 
362 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.249198  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3949  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  42.6 
 
 
357 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.994388 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5954  PHB depolymerase family esterase  46.44 
 
 
438 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.159743 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6439  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  45.32 
 
 
445 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1940  PHB depolymerase family esterase  39.27 
 
 
433 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3626  esterase, PHB depolymerase  42.39 
 
 
362 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155827  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2059  phospholipase/carboxylesterase  39.22 
 
 
343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.550035  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4018  hypothetical protein  39.03 
 
 
355 aa  169  8e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  33.64 
 
 
372 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  35.23 
 
 
367 aa  152  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2065  esterase, PHB depolymerase  35.61 
 
 
359 aa  152  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0523522  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1969  esterase, PHB depolymerase  36.34 
 
 
373 aa  150  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.127109  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3857  PHB depolymerase family esterase  33.44 
 
 
414 aa  149  8e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  35.59 
 
 
429 aa  148  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4281  PHB depolymerase family esterase  39.93 
 
 
403 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0631571 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3344  PHB depolymerase family esterase  36.43 
 
 
429 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.335799  normal  0.68562 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2576  esterase, PHB depolymerase  35.89 
 
 
396 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.225739  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2650  hypothetical protein  35.27 
 
 
355 aa  143  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376354  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4127  esterase, PHB depolymerase family  34.09 
 
 
419 aa  143  5e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  34.02 
 
 
312 aa  142  6e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6025  PHB depolymerase family esterase  38.35 
 
 
416 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950963  normal  0.103792 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1173  esterase, PHB depolymerase family  37.73 
 
 
410 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2770  PHB depolymerase family esterase  31.99 
 
 
544 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4027  PHB depolymerase family esterase  38.08 
 
 
387 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3819  PHB depolymerase family esterase  33.81 
 
 
419 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5706  PHB depolymerase family esterase  36.51 
 
 
438 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137114  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2991  PHB depolymerase family esterase  34.81 
 
 
419 aa  137  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3990  Poly (3-hydroxybutyrate ) depolymerase  32.4 
 
 
396 aa  136  5e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4615  PHB depolymerase family esterase  46.28 
 
 
359 aa  135  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1761  esterase, PHB depolymerase family  38.76 
 
 
422 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.496023 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1483  PHB depolymerase family esterase  39.04 
 
 
422 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0485134  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0535  esterase, PHB depolymerase family  37.45 
 
 
338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.660761  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5379  putative esterase, PHB depolymerase  38.01 
 
 
411 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.449035 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4102  hypothetical protein  34.17 
 
 
385 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.943667 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1484  esterase, PHB depolymerase family  38.62 
 
 
425 aa  132  9e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220911  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1990  esterase, PHB depolymerase family  34.8 
 
 
406 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000642829  normal  0.085302 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4273  esterase, PHB depolymerase  35.62 
 
 
394 aa  130  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2204  esterase, PHB depolymerase  34.64 
 
 
367 aa  130  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.667331  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3867  esterase, PHB depolymerase  36.7 
 
 
404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.10201  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3360  esterase, PHB depolymerase family  35.44 
 
 
419 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.995755 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  30.56 
 
 
334 aa  126  6e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1984  esterase, PHB depolymerase family  35.44 
 
 
337 aa  124  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000502853  normal  0.034342 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7065  esterase, PHB depolymerase family  36.21 
 
 
426 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.185362  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0209  esterase, PHB depolymerase family  34.5 
 
 
342 aa  122  7e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0493  esterase, PHB depolymerase family  30.66 
 
 
378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3660  PHB depolymerase family esterase  34.32 
 
 
381 aa  119  4.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.741995  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9052  polyhydroxybutyrate depolymerase  33.83 
 
 
366 aa  117  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6240  PHB depolymerase family esterase  35.9 
 
 
466 aa  116  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.721378 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4749  esterase, PHB depolymerase family  34.43 
 
 
343 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3823  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  33.21 
 
 
374 aa  112  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5113  esterase, PHB depolymerase  33.95 
 
 
370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4301  PHB depolymerase family esterase  36.4 
 
 
368 aa  109  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0371  esterase, PHB depolymerase  36.68 
 
 
394 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4602  esterase, PHB depolymerase  33.86 
 
 
317 aa  100  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0568  esterase, PHB depolymerase family  31.25 
 
 
395 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0935  putative polyhydroxyalkanoate depolymerase  30.96 
 
 
343 aa  97.1  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7674  putative polyhydroxy-alkanoate/butyrate(PHA/PHB) depolymerase  30.19 
 
 
529 aa  96.7  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1463  esterase, PHB depolymerase family  31.34 
 
 
363 aa  96.7  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0308241  normal  0.241375 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1658  hypothetical protein  33.2 
 
 
342 aa  94.7  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32348  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2820  esterase, PHB depolymerase family  28.66 
 
 
352 aa  94.4  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000611867  hitchhiker  0.00921779 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2179  esterase, PHB depolymerase family  29.88 
 
 
419 aa  94  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0711  esterase, PHB depolymerase  33.69 
 
 
392 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.612274  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3146  PHB depolymerase family esterase  34.57 
 
 
308 aa  89  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.616621  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3195  PHB depolymerase family esterase  34.57 
 
 
308 aa  89  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1658  esterase, PHB depolymerase family  33.67 
 
 
363 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.044626  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0137  esterase, PHB depolymerase  32.62 
 
 
392 aa  86.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06093  Acetylxylan esterase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS5]  28.93 
 
 
306 aa  85.1  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00247339 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3281  PHB depolymerase family esterase  29.91 
 
 
308 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.123573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0666  PHB depolymerase family esterase  29.91 
 
 
308 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.19814 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3290  esterase, PHB depolymerase family  25.33 
 
 
450 aa  82  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195473  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3457  PHB depolymerase family esterase  29.39 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00100534  normal  0.0484591 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>