185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1945 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1945  esterase, PHB depolymerase family  100 
 
 		 344 aa  704    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.198099  normal  0.0353299 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2268  esterase, PHB depolymerase family  98.26 
 
 		 344 aa  687    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493113  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2149  hypothetical protein  78.43 
 
 		 343 aa  555  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000536767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6802  esterase, PHB depolymerase family  43.47 
 
 		 398 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0419644  decreased coverage  0.000000125026 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2846  esterase, PHB depolymerase  43.57 
 
 		 398 aa  263  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4883  PHB depolymerase family esterase  46.96 
 
 		 369 aa  263  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103512  hitchhiker  0.0011428 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3665  PHB depolymerase family esterase  47.28 
 
 		 365 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.131134  normal  0.75521 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4502  esterase, PHB depolymerase  47.28 
 
 		 365 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42248  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3862  PHB depolymerase family esterase  47.28 
 
 		 365 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0810078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4407  PHB depolymerase family esterase  43.94 
 
 		 398 aa  256  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.32684  normal  0.707171 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2234  esterase, PHB depolymerase  46.96 
 
 		 369 aa  249  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111052  normal  0.321017 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0301  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  45.07 
 
 		 367 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0865  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  45.07 
 
 		 367 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208532  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1480  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  45.07 
 
 		 382 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289263  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1676  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  45.07 
 
 		 382 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.254076  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2562  depolymerase  45.07 
 
 		 382 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2425  PHB depolymerase family esterase  45.07 
 
 		 382 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0332  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  45.07 
 
 		 364 aa  236  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203676  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3230  PHB depolymerase family esterase  47.28 
 
 		 369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.891696  normal  0.152859 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3759  PHB depolymerase family esterase  47.28 
 
 		 369 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209534 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0595  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  43.65 
 
 		 364 aa  229  5e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7221  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  43.09 
 
 		 363 aa  210  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201442  normal  0.80823 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5982  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  40.62 
 
 		 358 aa  205  8e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6278  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  42.81 
 
 		 358 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2235  polyhydroxyalkanoate depolymerase domain-containing protein  40.78 
 
 		 427 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00861555  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1012  polyhydroxyalkanoate depolymerase domain-containing protein  40.78 
 
 		 427 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5573  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  45.32 
 
 		 421 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.95415  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5937  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  45.32 
 
 		 421 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3949  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  42.75 
 
 		 357 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.994388 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2039  PHB depolymerase family esterase  44.36 
 
 		 362 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.249198  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2094  PHB depolymerase family esterase  44.36 
 
 		 362 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5954  PHB depolymerase family esterase  43.96 
 
 		 438 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.159743 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6439  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  44.96 
 
 		 445 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3626  esterase, PHB depolymerase  37.69 
 
 		 362 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155827  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2059  phospholipase/carboxylesterase  39.22 
 
 		 343 aa  175  8e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.550035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4018  hypothetical protein  38.1 
 
 		 355 aa  173  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1940  PHB depolymerase family esterase  38.28 
 
 		 433 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  33.33 
 
 		 372 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  34.06 
 
 		 367 aa  153  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1969  esterase, PHB depolymerase  38.83 
 
 		 373 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.127109  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2065  esterase, PHB depolymerase  34.89 
 
 		 359 aa  147  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0523522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2576  esterase, PHB depolymerase  35.54 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.225739  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  35.23 
 
 		 429 aa  145  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3857  PHB depolymerase family esterase  33.12 
 
 		 414 aa  145  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4281  PHB depolymerase family esterase  39.93 
 
 		 403 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0631571 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3344  PHB depolymerase family esterase  35.91 
 
 		 429 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.335799  normal  0.68562 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2650  hypothetical protein  35.87 
 
 		 355 aa  143  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  34.02 
 
 		 312 aa  143  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6025  PHB depolymerase family esterase  38.35 
 
 		 416 aa  143  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950963  normal  0.103792 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4127  esterase, PHB depolymerase family  36.49 
 
 		 419 aa  142  8e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2770  PHB depolymerase family esterase  32.62 
 
 		 544 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4027  PHB depolymerase family esterase  38.3 
 
 		 387 aa  139  7e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1173  esterase, PHB depolymerase family  38.32 
 
 		 410 aa  139  7.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3819  PHB depolymerase family esterase  36.14 
 
 		 419 aa  138  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3990  Poly (3-hydroxybutyrate ) depolymerase  33.82 
 
 		 396 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0535  esterase, PHB depolymerase family  37.45 
 
 		 338 aa  135  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.660761  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1761  esterase, PHB depolymerase family  38.44 
 
 		 422 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.496023 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4273  esterase, PHB depolymerase  36.52 
 
 		 394 aa  134  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4102  hypothetical protein  34.17 
 
 		 385 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.943667 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5379  putative esterase, PHB depolymerase  38.91 
 
 		 411 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.449035 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5706  PHB depolymerase family esterase  36.33 
 
 		 438 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137114  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2991  PHB depolymerase family esterase  34.44 
 
 		 419 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1483  PHB depolymerase family esterase  38.7 
 
 		 422 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0485134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1990  esterase, PHB depolymerase family  34.8 
 
 		 406 aa  132  6.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000642829  normal  0.085302 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1484  esterase, PHB depolymerase family  38.28 
 
 		 425 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220911  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4615  PHB depolymerase family esterase  45.74 
 
 		 359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3360  esterase, PHB depolymerase family  37.87 
 
 		 419 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.995755 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2204  esterase, PHB depolymerase  34.29 
 
 		 367 aa  129  7.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.667331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3867  esterase, PHB depolymerase  37.69 
 
 		 404 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.10201  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7065  esterase, PHB depolymerase family  36.52 
 
 		 426 aa  126  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.185362  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  30.21 
 
 		 334 aa  125  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0209  esterase, PHB depolymerase family  34.5 
 
 		 342 aa  123  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0493  esterase, PHB depolymerase family  30.58 
 
 		 378 aa  122  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1984  esterase, PHB depolymerase family  35.09 
 
 		 337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000502853  normal  0.034342 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3660  PHB depolymerase family esterase  32.96 
 
 		 381 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.741995  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4749  esterase, PHB depolymerase family  34.84 
 
 		 343 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6240  PHB depolymerase family esterase  36.86 
 
 		 466 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.721378 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9052  polyhydroxybutyrate depolymerase  33.5 
 
 		 366 aa  113  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5113  esterase, PHB depolymerase  33.95 
 
 		 370 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3823  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  33.58 
 
 		 374 aa  112  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4301  PHB depolymerase family esterase  36.4 
 
 		 368 aa  109  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0371  esterase, PHB depolymerase  36.22 
 
 		 394 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0568  esterase, PHB depolymerase family  30.95 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4602  esterase, PHB depolymerase  33.86 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7674  putative polyhydroxy-alkanoate/butyrate(PHA/PHB) depolymerase  32.91 
 
 		 529 aa  98.6  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0935  putative polyhydroxyalkanoate depolymerase  30.96 
 
 		 343 aa  97.1  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1463  esterase, PHB depolymerase family  31 
 
 		 363 aa  95.9  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0308241  normal  0.241375 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2820  esterase, PHB depolymerase family  28.66 
 
 		 352 aa  95.1  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000611867  hitchhiker  0.00921779 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1658  hypothetical protein  29.87 
 
 		 342 aa  95.1  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32348  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2179  esterase, PHB depolymerase family  30.51 
 
 		 419 aa  94.7  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0711  esterase, PHB depolymerase  32.66 
 
 		 392 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.612274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3146  PHB depolymerase family esterase  34.69 
 
 		 308 aa  90.1  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.616621  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3195  PHB depolymerase family esterase  34.69 
 
 		 308 aa  90.1  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0137  esterase, PHB depolymerase  31.66 
 
 		 392 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1658  esterase, PHB depolymerase family  34.01 
 
 		 363 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.044626  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3281  PHB depolymerase family esterase  29.91 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.123573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0666  PHB depolymerase family esterase  29.91 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.19814 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06093  Acetylxylan esterase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS5]  29.19 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00247339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3290  esterase, PHB depolymerase family  25.33 
 
 		 450 aa  82.4  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3457  PHB depolymerase family esterase  29.49 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00100534  normal  0.0484591 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>