137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0935 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0935  putative polyhydroxyalkanoate depolymerase  100 
 
 		 343 aa  708    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3281  PHB depolymerase family esterase  50 
 
 		 308 aa  273  3e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.123573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0666  PHB depolymerase family esterase  50 
 
 		 308 aa  273  3e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.19814 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3457  PHB depolymerase family esterase  49.65 
 
 		 308 aa  271  9e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00100534  normal  0.0484591 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0520  putative polyhydroxyalkanoate depolymerase  49.65 
 
 		 315 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.213794 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3172  esterase, PHB depolymerase family protein  47.33 
 
 		 300 aa  265  1e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0370898  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4602  esterase, PHB depolymerase  37.33 
 
 		 317 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0711  esterase, PHB depolymerase  37.28 
 
 		 392 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.612274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0568  esterase, PHB depolymerase family  36.24 
 
 		 395 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0371  esterase, PHB depolymerase  35.92 
 
 		 394 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1463  esterase, PHB depolymerase family  36.68 
 
 		 363 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0308241  normal  0.241375 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0137  esterase, PHB depolymerase  35.79 
 
 		 392 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3660  PHB depolymerase family esterase  35.99 
 
 		 381 aa  185  8e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.741995  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7674  putative polyhydroxy-alkanoate/butyrate(PHA/PHB) depolymerase  36.24 
 
 		 529 aa  185  9e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0048  esterase, PHB depolymerase family  33.33 
 
 		 417 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616843 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4749  esterase, PHB depolymerase family  35.84 
 
 		 343 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0082  esterase, PHB depolymerase  32.47 
 
 		 414 aa  176  7e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31730  esterase, PHB depolymerase family  36.08 
 
 		 331 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4301  PHB depolymerase family esterase  33.92 
 
 		 368 aa  172  6.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9052  polyhydroxybutyrate depolymerase  33.68 
 
 		 366 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1658  esterase, PHB depolymerase family  35.89 
 
 		 363 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.044626  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2179  esterase, PHB depolymerase family  36.67 
 
 		 419 aa  164  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3146  PHB depolymerase family esterase  32.87 
 
 		 308 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.616621  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3195  PHB depolymerase family esterase  32.87 
 
 		 308 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3290  esterase, PHB depolymerase family  33.1 
 
 		 450 aa  162  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1658  hypothetical protein  34.72 
 
 		 342 aa  156  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32348  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  30.34 
 
 		 372 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2991  PHB depolymerase family esterase  36.07 
 
 		 419 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2650  hypothetical protein  30.56 
 
 		 355 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3990  Poly (3-hydroxybutyrate ) depolymerase  35.68 
 
 		 396 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  29.43 
 
 		 429 aa  116  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2204  esterase, PHB depolymerase  34.17 
 
 		 367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.667331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4027  PHB depolymerase family esterase  35.2 
 
 		 387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3857  PHB depolymerase family esterase  31.15 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  29.3 
 
 		 312 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2576  esterase, PHB depolymerase  36.08 
 
 		 396 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.225739  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2770  PHB depolymerase family esterase  29.67 
 
 		 544 aa  113  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  35.03 
 
 		 367 aa  113  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4502  esterase, PHB depolymerase  32.14 
 
 		 365 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42248  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3862  PHB depolymerase family esterase  32.14 
 
 		 365 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0810078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  27.95 
 
 		 436 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3665  PHB depolymerase family esterase  32.14 
 
 		 365 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.131134  normal  0.75521 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4883  PHB depolymerase family esterase  33.17 
 
 		 369 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103512  hitchhiker  0.0011428 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4102  hypothetical protein  29.83 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.943667 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2059  phospholipase/carboxylesterase  32.14 
 
 		 343 aa  103  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.550035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4407  PHB depolymerase family esterase  30.93 
 
 		 398 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.32684  normal  0.707171 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2234  esterase, PHB depolymerase  29.08 
 
 		 369 aa  102  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111052  normal  0.321017 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0595  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  28.78 
 
 		 364 aa  102  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2846  esterase, PHB depolymerase  32.81 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  29.13 
 
 		 422 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1990  esterase, PHB depolymerase family  33.15 
 
 		 406 aa  101  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000642829  normal  0.085302 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6802  esterase, PHB depolymerase family  31.77 
 
 		 398 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0419644  decreased coverage  0.000000125026 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  27.2 
 
 		 518 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  27.65 
 
 		 451 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2065  esterase, PHB depolymerase  28.63 
 
 		 359 aa  97.8  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0523522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3344  PHB depolymerase family esterase  32.5 
 
 		 429 aa  98.6  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.335799  normal  0.68562 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1484  esterase, PHB depolymerase family  29.4 
 
 		 425 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220911  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2820  esterase, PHB depolymerase family  28.8 
 
 		 352 aa  97.4  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000611867  hitchhiker  0.00921779 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1945  esterase, PHB depolymerase family  30.85 
 
 		 344 aa  97.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.198099  normal  0.0353299 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  27.2 
 
 		 442 aa  97.1  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2268  esterase, PHB depolymerase family  30.85 
 
 		 344 aa  97.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1480  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  27.68 
 
 		 382 aa  95.9  8e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289263  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1676  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  27.68 
 
 		 382 aa  95.9  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.254076  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2562  depolymerase  27.68 
 
 		 382 aa  95.9  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2425  PHB depolymerase family esterase  27.68 
 
 		 382 aa  95.9  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0301  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  27.68 
 
 		 367 aa  95.9  9e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0865  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  27.68 
 
 		 367 aa  95.9  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208532  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0332  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  27.68 
 
 		 364 aa  95.9  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203676  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  25.87 
 
 		 423 aa  95.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0493  esterase, PHB depolymerase family  26.69 
 
 		 378 aa  94.7  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1761  esterase, PHB depolymerase family  29.18 
 
 		 422 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.496023 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1483  PHB depolymerase family esterase  28.79 
 
 		 422 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0485134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  30.41 
 
 		 334 aa  93.2  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2149  hypothetical protein  28.14 
 
 		 343 aa  90.1  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000536767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1969  esterase, PHB depolymerase  29.92 
 
 		 373 aa  90.1  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.127109  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0535  esterase, PHB depolymerase family  33.33 
 
 		 338 aa  88.6  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.660761  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3759  PHB depolymerase family esterase  31.69 
 
 		 369 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209534 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3230  PHB depolymerase family esterase  31.28 
 
 		 369 aa  87.4  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.891696  normal  0.152859 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5113  esterase, PHB depolymerase  28.92 
 
 		 370 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2245  esterase, PHB depolymerase family  23.66 
 
 		 432 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.386893 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3823  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  25.37 
 
 		 374 aa  85.1  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5954  PHB depolymerase family esterase  28.12 
 
 		 438 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.159743 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5706  PHB depolymerase family esterase  32.02 
 
 		 438 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137114  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1173  esterase, PHB depolymerase family  32.14 
 
 		 410 aa  84  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  23.17 
 
 		 656 aa  84.3  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4018  hypothetical protein  28.1 
 
 		 355 aa  83.2  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7065  esterase, PHB depolymerase family  31.9 
 
 		 426 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.185362  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5982  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  27.54 
 
 		 358 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4281  PHB depolymerase family esterase  28.24 
 
 		 403 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0631571 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6240  PHB depolymerase family esterase  33.33 
 
 		 466 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.721378 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7221  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  27.27 
 
 		 363 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201442  normal  0.80823 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6278  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  27.05 
 
 		 358 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1012  polyhydroxyalkanoate depolymerase domain-containing protein  29.15 
 
 		 427 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2039  PHB depolymerase family esterase  29.15 
 
 		 362 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.249198  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2094  PHB depolymerase family esterase  29.15 
 
 		 362 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4127  esterase, PHB depolymerase family  32.62 
 
 		 419 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4615  PHB depolymerase family esterase  30.56 
 
 		 359 aa  76.6  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06093  Acetylxylan esterase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS5]  26.46 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00247339 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3819  PHB depolymerase family esterase  32.09 
 
 		 419 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2235  polyhydroxyalkanoate depolymerase domain-containing protein  28.7 
 
 		 427 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00861555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>