More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2245 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2245  esterase, PHB depolymerase family  100 
 
 		 432 aa  874    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.386893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  63.4 
 
 		 423 aa  540  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  59.95 
 
 		 442 aa  532  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  50 
 
 		 436 aa  395  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  48.88 
 
 		 422 aa  373  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  56.1 
 
 		 656 aa  335  7e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  56.12 
 
 		 518 aa  322  7e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  56.47 
 
 		 451 aa  321  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  50.52 
 
 		 489 aa  298  1e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06093  Acetylxylan esterase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS5]  38.39 
 
 		 306 aa  223  7e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00247339 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0082  esterase, PHB depolymerase  39.67 
 
 		 414 aa  196  7e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0048  esterase, PHB depolymerase family  41.4 
 
 		 417 aa  196  8.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3290  esterase, PHB depolymerase family  41.48 
 
 		 450 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2179  esterase, PHB depolymerase family  39.31 
 
 		 419 aa  187  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0371  esterase, PHB depolymerase  37.31 
 
 		 394 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3660  PHB depolymerase family esterase  37.07 
 
 		 381 aa  169  6e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.741995  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31730  esterase, PHB depolymerase family  37.83 
 
 		 331 aa  163  6e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0711  esterase, PHB depolymerase  38.56 
 
 		 392 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.612274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0137  esterase, PHB depolymerase  32.89 
 
 		 392 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0568  esterase, PHB depolymerase family  35.61 
 
 		 395 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4749  esterase, PHB depolymerase family  33.94 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4602  esterase, PHB depolymerase  31.6 
 
 		 317 aa  144  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  32.91 
 
 		 436 aa  141  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9052  polyhydroxybutyrate depolymerase  30.19 
 
 		 366 aa  139  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1463  esterase, PHB depolymerase family  32.57 
 
 		 363 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0308241  normal  0.241375 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7674  putative polyhydroxy-alkanoate/butyrate(PHA/PHB) depolymerase  33.33 
 
 		 529 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4301  PHB depolymerase family esterase  35.36 
 
 		 368 aa  131  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1658  esterase, PHB depolymerase family  33.33 
 
 		 363 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.044626  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  54.46 
 
 		 487 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1658  hypothetical protein  30.63 
 
 		 342 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32348  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  50.49 
 
 		 393 aa  106  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  46.6 
 
 		 488 aa  103  4e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  48.54 
 
 		 623 aa  104  4e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  48.54 
 
 		 842 aa  103  7e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  37.74 
 
 		 998 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  47.62 
 
 		 597 aa  102  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3146  PHB depolymerase family esterase  30.57 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.616621  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3195  PHB depolymerase family esterase  30.57 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  49.02 
 
 		 580 aa  100  6e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  47.62 
 
 		 690 aa  100  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  38.18 
 
 		 880 aa  99.8  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  47.62 
 
 		 854 aa  99  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  46.53 
 
 		 934 aa  98.6  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  47.17 
 
 		 376 aa  97.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  41.38 
 
 		 669 aa  95.9  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  37.21 
 
 		 372 aa  95.9  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  46.67 
 
 		 646 aa  95.9  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  45.54 
 
 		 990 aa  95.9  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  36.62 
 
 		 367 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  48.04 
 
 		 688 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  43.27 
 
 		 1007 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  46.3 
 
 		 785 aa  91.3  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  31.7 
 
 		 334 aa  91.3  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  38.89 
 
 		 875 aa  90.9  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  40.59 
 
 		 775 aa  90.5  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  48.42 
 
 		 778 aa  90.1  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  44.64 
 
 		 420 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  44.55 
 
 		 746 aa  89  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4027  PHB depolymerase family esterase  35.81 
 
 		 387 aa  87.8  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  45.1 
 
 		 589 aa  86.7  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2770  PHB depolymerase family esterase  29.06 
 
 		 544 aa  86.7  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0520  putative polyhydroxyalkanoate depolymerase  27.15 
 
 		 315 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.213794 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  42 
 
 		 966 aa  86.3  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  41.18 
 
 		 727 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0935  putative polyhydroxyalkanoate depolymerase  23.57 
 
 		 343 aa  85.1  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  41.75 
 
 		 906 aa  85.5  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  43.56 
 
 		 744 aa  85.1  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  43.14 
 
 		 620 aa  84.7  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  45.1 
 
 		 743 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  40 
 
 		 596 aa  84  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  36.27 
 
 		 984 aa  83.6  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  39.42 
 
 		 628 aa  83.6  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 		 963 aa  83.2  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  44.32 
 
 		 938 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  38.1 
 
 		 491 aa  82  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  41.58 
 
 		 979 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  44.71 
 
 		 460 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0493  esterase, PHB depolymerase family  31.4 
 
 		 378 aa  80.5  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  38.89 
 
 		 913 aa  80.1  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6802  esterase, PHB depolymerase family  29.53 
 
 		 398 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0419644  decreased coverage  0.000000125026 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  43.16 
 
 		 494 aa  79.7  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2846  esterase, PHB depolymerase  29.57 
 
 		 398 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  40.71 
 
 		 942 aa  79.7  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  42.11 
 
 		 598 aa  79  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  39 
 
 		 767 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2268  esterase, PHB depolymerase family  30.43 
 
 		 344 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4615  PHB depolymerase family esterase  38.97 
 
 		 359 aa  79  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4407  PHB depolymerase family esterase  28.16 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.32684  normal  0.707171 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  37.25 
 
 		 364 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  45.36 
 
 		 485 aa  78.2  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  39.6 
 
 		 590 aa  78.2  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  37.17 
 
 		 533 aa  77.4  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  40.38 
 
 		 429 aa  76.6  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  39.81 
 
 		 925 aa  75.9  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  36.63 
 
 		 588 aa  76.3  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  38.89 
 
 		 864 aa  75.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0666  PHB depolymerase family esterase  24.01 
 
 		 308 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.19814 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6682  cellulose-binding family II  41.35 
 
 		 935 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3857  PHB depolymerase family esterase  35 
 
 		 414 aa  76.3  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  39.22 
 
 		 681 aa  75.5  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>