296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4958 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  100 
 
 		 451 aa  922    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  98.4 
 
 		 518 aa  609  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  55.73 
 
 		 656 aa  342  1e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  59.38 
 
 		 436 aa  338  8e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  55.02 
 
 		 442 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  57 
 
 		 423 aa  332  6e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2245  esterase, PHB depolymerase family  54.75 
 
 		 432 aa  322  8e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.386893 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  56.9 
 
 		 422 aa  318  1e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  47.77 
 
 		 489 aa  274  3e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06093  Acetylxylan esterase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS5]  40.58 
 
 		 306 aa  218  2e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00247339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  80.47 
 
 		 461 aa  215  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3290  esterase, PHB depolymerase family  44.69 
 
 		 450 aa  213  7e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  76.19 
 
 		 472 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  75.78 
 
 		 801 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  75 
 
 		 490 aa  202  9e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  73.81 
 
 		 498 aa  197  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  73.64 
 
 		 493 aa  196  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  74.02 
 
 		 489 aa  194  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2179  esterase, PHB depolymerase family  37.05 
 
 		 419 aa  183  6e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  70.87 
 
 		 380 aa  183  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0082  esterase, PHB depolymerase  38.1 
 
 		 414 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  72.44 
 
 		 468 aa  182  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  68.25 
 
 		 547 aa  179  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0048  esterase, PHB depolymerase family  35.1 
 
 		 417 aa  173  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  63.49 
 
 		 500 aa  167  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3660  PHB depolymerase family esterase  33.21 
 
 		 381 aa  166  5.9999999999999996e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.741995  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31730  esterase, PHB depolymerase family  34.24 
 
 		 331 aa  157  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  61.16 
 
 		 558 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  62.5 
 
 		 374 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  52.87 
 
 		 603 aa  150  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  58.59 
 
 		 492 aa  150  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0371  esterase, PHB depolymerase  35.29 
 
 		 394 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  49.38 
 
 		 469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  57.94 
 
 		 535 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0711  esterase, PHB depolymerase  33.93 
 
 		 392 aa  144  5e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.612274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  60.17 
 
 		 801 aa  143  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0137  esterase, PHB depolymerase  32.34 
 
 		 392 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1463  esterase, PHB depolymerase family  30.45 
 
 		 363 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0308241  normal  0.241375 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4602  esterase, PHB depolymerase  30.22 
 
 		 317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0568  esterase, PHB depolymerase family  30.94 
 
 		 395 aa  136  9e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  55.2 
 
 		 489 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  51.56 
 
 		 368 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7674  putative polyhydroxy-alkanoate/butyrate(PHA/PHB) depolymerase  31.5 
 
 		 529 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4749  esterase, PHB depolymerase family  28.52 
 
 		 343 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  49.22 
 
 		 589 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9052  polyhydroxybutyrate depolymerase  29.56 
 
 		 366 aa  124  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  40.54 
 
 		 548 aa  120  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1658  esterase, PHB depolymerase family  30.8 
 
 		 363 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.044626  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4301  PHB depolymerase family esterase  31.62 
 
 		 368 aa  118  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  46.4 
 
 		 497 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  47.66 
 
 		 803 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  48.18 
 
 		 801 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  45.12 
 
 		 479 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  49.6 
 
 		 568 aa  111  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  45.31 
 
 		 492 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1658  hypothetical protein  28.76 
 
 		 342 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32348  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  41.98 
 
 		 890 aa  103  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  45.83 
 
 		 634 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0935  putative polyhydroxyalkanoate depolymerase  27.34 
 
 		 343 aa  99.4  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  41.13 
 
 		 567 aa  97.8  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  46.09 
 
 		 446 aa  97.1  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  40.15 
 
 		 516 aa  96.7  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.53 
 
 		 933 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  49.17 
 
 		 384 aa  91.3  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0520  putative polyhydroxyalkanoate depolymerase  27.42 
 
 		 315 aa  91.3  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.213794 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  38.06 
 
 		 391 aa  90.9  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3146  PHB depolymerase family esterase  25.52 
 
 		 308 aa  90.9  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.616621  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3195  PHB depolymerase family esterase  25.52 
 
 		 308 aa  90.9  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  38.98 
 
 		 426 aa  90.5  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  44.17 
 
 		 452 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  39.1 
 
 		 414 aa  88.6  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  36.3 
 
 		 709 aa  88.2  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5166  Ricin B lectin  38.71 
 
 		 642 aa  87.4  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400775  normal  0.0878066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  45 
 
 		 373 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  41.67 
 
 		 732 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  40.15 
 
 		 165 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.17 
 
 		 1072 aa  84.7  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  42.31 
 
 		 574 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4280  Ricin B lectin  38.4 
 
 		 494 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.104165 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  41.09 
 
 		 1016 aa  83.2  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  38.98 
 
 		 417 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  39.46 
 
 		 824 aa  82.4  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2770  PHB depolymerase family esterase  27.59 
 
 		 544 aa  80.9  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  27.78 
 
 		 334 aa  80.9  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  34.55 
 
 		 627 aa  80.5  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  36.07 
 
 		 465 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  25.08 
 
 		 429 aa  78.6  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  38.75 
 
 		 1207 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.54 
 
 		 531 aa  79  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4027  PHB depolymerase family esterase  25 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  34.56 
 
 		 488 aa  78.2  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0493  esterase, PHB depolymerase family  26.32 
 
 		 378 aa  77.8  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  26.23 
 
 		 367 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  27.17 
 
 		 372 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  35.25 
 
 		 522 aa  76.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  35 
 
 		 496 aa  74.7  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  32.05 
 
 		 597 aa  73.9  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3990  Poly (3-hydroxybutyrate ) depolymerase  25.81 
 
 		 396 aa  73.6  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  31.03 
 
 		 476 aa  73.2  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.34 
 
 		 815 aa  72.4  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>