28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4772 on replicon NC_008761
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008761  Pnap_4772  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  100 
 
 		 356 aa  741    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.826591 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0665  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  71.63 
 
 		 355 aa  548  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.097547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5512  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  71.67 
 
 		 387 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.292347 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34710  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase protein  39.55 
 
 		 338 aa  274  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.222008  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4785  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  42.49 
 
 		 374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4259  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  42.33 
 
 		 322 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00982049 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0127  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  37.43 
 
 		 347 aa  218  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3159  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  37.22 
 
 		 340 aa  216  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2417  Fibronectin type III domain protein  35.9 
 
 		 485 aa  205  8e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1238  fibronectin, type III domain-containing protein  34.48 
 
 		 485 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.109718  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1585  putative depolymerase  35.71 
 
 		 362 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0731101  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2303  polyhydroxybutyrate depolymerase  35.01 
 
 		 348 aa  189  7e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2068  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  35.16 
 
 		 358 aa  189  7e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.151389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5328  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  34.91 
 
 		 317 aa  176  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2146  polyhydroxybutyrate depolymerase  35.01 
 
 		 341 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.286329  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2089  polyhydroxybutyrate depolymerase  35.01 
 
 		 341 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0176  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  33.62 
 
 		 375 aa  172  5.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2280  hypothetical protein  35.01 
 
 		 341 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70217  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1977  polyhydroxybutyrate depolymerase  31.53 
 
 		 369 aa  167  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02265  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  30.12 
 
 		 353 aa  158  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1082  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  31.85 
 
 		 352 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2065  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  30.14 
 
 		 506 aa  150  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.140778  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07987  polyhydroxybutyrate depolymerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03560)  30.49 
 
 		 377 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.445833  normal  0.346264 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2373  fibronectin, type III domain-containing protein  29.89 
 
 		 385 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4864  putative depolymerase  26.52 
 
 		 404 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1647  putative depolymerase  25.71 
 
 		 391 aa  97.1  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543513  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5556  putative depolymerase  25.45 
 
 		 403 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31730  esterase, PHB depolymerase family  34.94 
 
 		 331 aa  42.7  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>