74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2773 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2774  hypothetical protein  84.3 
 
 
691 aa  1133    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134072  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2773  fibronectin, type III  100 
 
 
1115 aa  2210    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2778  hypothetical protein  52.7 
 
 
611 aa  572  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.4151  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3516  hypothetical protein  38.67 
 
 
691 aa  359  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.716202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3182  hypothetical protein  29.85 
 
 
582 aa  187  9e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1079  hypothetical protein  30.03 
 
 
582 aa  183  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0640  cellulosome enzyme, dockerin type I  27.86 
 
 
582 aa  157  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0964  hypothetical protein  26.73 
 
 
578 aa  153  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296156  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2662  Ig domain protein group 2 domain protein  55.32 
 
 
332 aa  92.4  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10701  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0451  Ig-like, group 2  58.51 
 
 
770 aa  90.9  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.387069 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2757  Ig domain protein group 2 domain protein  54.26 
 
 
332 aa  89  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3118  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  36.31 
 
 
818 aa  88.6  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.222033  normal  0.0458046 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1208  calcium-binding outer membrane-like protein  61.9 
 
 
331 aa  88.6  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1233  Ig domain-containing protein  58.44 
 
 
619 aa  84.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.154947 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3592  hypothetical protein  55.42 
 
 
743 aa  82  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.348874 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2960  PKD domain containing protein  49.04 
 
 
687 aa  80.9  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2868  PKD domain containing protein  49.04 
 
 
687 aa  80.9  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3595  kelch domain-containing protein  42.27 
 
 
833 aa  72  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.066444 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  42.2 
 
 
3802 aa  68.2  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2065  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  44.34 
 
 
506 aa  66.2  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.140778  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2143  cytochrome c family protein  45.24 
 
 
310 aa  66.2  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000152859  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2666  glycosy hydrolase family protein  32.3 
 
 
970 aa  63.9  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  38.39 
 
 
1199 aa  63.2  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04176  exoglucanase A  43.43 
 
 
548 aa  62.8  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  41 
 
 
1307 aa  60.8  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  45.74 
 
 
680 aa  60.1  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2009  hypothetical protein  39.56 
 
 
115 aa  56.6  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.38923  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  35.38 
 
 
869 aa  56.6  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  37.1 
 
 
1401 aa  54.7  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2675  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  32.59 
 
 
834 aa  54.3  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.343316 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  42.53 
 
 
492 aa  54.3  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.381426  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  35.21 
 
 
2068 aa  53.5  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  38.53 
 
 
2286 aa  53.5  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  36.28 
 
 
1067 aa  52.8  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1170  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  25.82 
 
 
693 aa  52.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000394833  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2384  hypothetical protein  33.88 
 
 
415 aa  52.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.458902  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  39.77 
 
 
1401 aa  52.8  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2625  hypothetical protein  30.32 
 
 
429 aa  52.4  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.17 
 
 
795 aa  52.4  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2417  Fibronectin type III domain protein  34.46 
 
 
485 aa  52  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  36.78 
 
 
692 aa  51.2  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0068  fibronectin, type III domain-containing protein  39.78 
 
 
1695 aa  50.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  41.38 
 
 
648 aa  51.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1543  cellulosome anchoring protein cohesin region  42.86 
 
 
782 aa  50.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000430269  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1740  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  39.53 
 
 
492 aa  49.7  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.548806  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0824  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  39.53 
 
 
492 aa  49.7  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0168099  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1342  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase precursor  39.53 
 
 
492 aa  49.7  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.968046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0529  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  39.53 
 
 
492 aa  49.7  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  33.66 
 
 
6885 aa  49.7  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1547  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  39.53 
 
 
492 aa  49.7  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  25.69 
 
 
1847 aa  49.7  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1570  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase precursor  39.53 
 
 
492 aa  49.7  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1747  hypothetical protein  34.34 
 
 
1139 aa  49.7  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564232 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0624  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase precursor  39.53 
 
 
492 aa  49.7  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.520528  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2403  PA14 domain protein  31.13 
 
 
1172 aa  49.3  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1793  fibronectin type III domain-containing protein  31.58 
 
 
224 aa  48.9  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1314  Fibronectin type III domain protein  37.5 
 
 
211 aa  48.1  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000146829  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  39.29 
 
 
2334 aa  48.1  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2672  glycosy hydrolase family protein  39.39 
 
 
1193 aa  48.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947842  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  34.38 
 
 
948 aa  47.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1238  fibronectin, type III domain-containing protein  44.12 
 
 
485 aa  47.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.109718  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0704  Fibronectin type III domain protein  27.22 
 
 
718 aa  47  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  34.31 
 
 
480 aa  47.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  45.78 
 
 
1160 aa  47  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0648  Fibronectin type III domain protein  34.69 
 
 
972 aa  46.2  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  32.71 
 
 
864 aa  46.2  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  40.96 
 
 
649 aa  46.2  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  32.5 
 
 
1351 aa  46.2  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2185  fibronectin, type III  42.86 
 
 
656 aa  46.2  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0292079  hitchhiker  0.000132126 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6366  putative transmembrane protein  35.51 
 
 
739 aa  46.2  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  33.06 
 
 
9585 aa  45.4  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01652  putative transmembrane protein  40.4 
 
 
767 aa  45.4  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.993678  normal  0.0258768 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1117  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  36.44 
 
 
724 aa  45.1  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0579806  normal  0.63577 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  39.08 
 
 
1121 aa  44.7  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>