28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2143 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2143  cytochrome c family protein  100 
 
 		 310 aa  608  1e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000152859  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1851  hypothetical protein  33.59 
 
 		 265 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2022  fibronectin, type III domain-containing protein  34.53 
 
 		 683 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00638663  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1761  cytochrome c family protein  35.1 
 
 		 511 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0745977  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2329  cytochrome c family protein  36.36 
 
 		 442 aa  93.6  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1881  cytochrome c family protein  35.47 
 
 		 510 aa  91.3  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  29.87 
 
 		 692 aa  82  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3334  hypothetical protein  32.79 
 
 		 595 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000666243  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5050  hypothetical protein  32.74 
 
 		 700 aa  66.2  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.567325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2773  fibronectin, type III  45.24 
 
 		 1115 aa  65.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2774  hypothetical protein  43.04 
 
 		 691 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134072  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3418  hypothetical protein  32.69 
 
 		 611 aa  60.1  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00172451  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0621  hypothetical protein  29.52 
 
 		 572 aa  60.1  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0112411  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0451  Ig-like, group 2  42.86 
 
 		 770 aa  58.9  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.387069 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1742  hypothetical protein  33.93 
 
 		 231 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0658117  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3516  hypothetical protein  44.58 
 
 		 691 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.716202  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3592  hypothetical protein  39.08 
 
 		 743 aa  55.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.348874 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3844  hypothetical protein  31.58 
 
 		 694 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2625  hypothetical protein  43.55 
 
 		 429 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2757  Ig domain protein group 2 domain protein  41.11 
 
 		 332 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1233  Ig domain-containing protein  40 
 
 		 619 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.154947 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2662  Ig domain protein group 2 domain protein  40 
 
 		 332 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10701  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0085  hypothetical protein  39.17 
 
 		 546 aa  49.7  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2794  hypothetical protein  34.78 
 
 		 238 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2960  PKD domain containing protein  51.02 
 
 		 687 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2672  glycosy hydrolase family protein  40.23 
 
 		 1193 aa  46.2  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947842  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2868  PKD domain containing protein  48.98 
 
 		 687 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1208  calcium-binding outer membrane-like protein  41.38 
 
 		 331 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>