29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0085 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0085  hypothetical protein  100 
 
 		 546 aa  1070    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0370  hypothetical protein  32.68 
 
 		 525 aa  182  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2794  hypothetical protein  50 
 
 		 238 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5050  hypothetical protein  37.83 
 
 		 700 aa  73.9  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.567325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2038  lipoprotein, putative  35.71 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000251498 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1589  hypothetical protein  41.91 
 
 		 230 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0108  putative lipoprotein  38.32 
 
 		 230 aa  72  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0134  putative lipoprotein  41.91 
 
 		 230 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0101  putative lipoprotein  41.18 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.319012  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1287  hypothetical protein  41.48 
 
 		 249 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6632  hypothetical protein  36.75 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0512  hypothetical protein  45.65 
 
 		 239 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3844  hypothetical protein  33.94 
 
 		 694 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4090  hypothetical protein  47.37 
 
 		 229 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.503896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3982  hypothetical protein  37.27 
 
 		 230 aa  62  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.122943 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4558  hypothetical protein  39.71 
 
 		 229 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.396699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3810  hypothetical protein  39.71 
 
 		 229 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.3727  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5746  hypothetical protein  39.71 
 
 		 229 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0879668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4446  hypothetical protein  38.24 
 
 		 230 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.348408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1860  hypothetical protein  34.26 
 
 		 546 aa  59.3  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3662  cell wall surface anchor family protein, putative  35 
 
 		 659 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1103  hypothetical protein  42.86 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0621  hypothetical protein  33.68 
 
 		 572 aa  56.6  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0112411  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1402  hypothetical protein  36.87 
 
 		 698 aa  55.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.863964  normal  0.205205 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2291  hypothetical protein  32.13 
 
 		 660 aa  53.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2329  cytochrome c family protein  34.93 
 
 		 442 aa  51.2  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3418  hypothetical protein  31.74 
 
 		 611 aa  46.2  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00172451  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5016  hypothetical protein  42.11 
 
 		 706 aa  45.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276526  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1881  cytochrome c family protein  34.88 
 
 		 510 aa  45.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>