40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2960 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_2868  PKD domain containing protein  98.11 
 
 
687 aa  1358    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2763  hypothetical protein  74.86 
 
 
1117 aa  840    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2960  PKD domain containing protein  100 
 
 
687 aa  1374    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2856  hypothetical protein  74.86 
 
 
1117 aa  840    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00658326  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2973  PKD domain containing protein  50.09 
 
 
586 aa  500  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.234709  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2881  PKD domain containing protein  50 
 
 
588 aa  492  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3516  hypothetical protein  54.64 
 
 
691 aa  88.2  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.716202  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2774  hypothetical protein  45.22 
 
 
691 aa  82.4  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134072  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2773  fibronectin, type III  49.04 
 
 
1115 aa  80.5  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1208  calcium-binding outer membrane-like protein  54.43 
 
 
331 aa  72.4  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2662  Ig domain protein group 2 domain protein  44.35 
 
 
332 aa  70.1  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10701  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2757  Ig domain protein group 2 domain protein  43.48 
 
 
332 aa  67.4  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  42.35 
 
 
1206 aa  63.9  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3595  kelch domain-containing protein  45.65 
 
 
833 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.066444 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0451  Ig-like, group 2  46.08 
 
 
770 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.387069 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1233  Ig domain-containing protein  46.05 
 
 
619 aa  61.6  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.154947 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  41.38 
 
 
1236 aa  60.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2009  hypothetical protein  35.92 
 
 
115 aa  53.9  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.38923  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  28.83 
 
 
816 aa  51.2  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2625  hypothetical protein  36.5 
 
 
429 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  32.35 
 
 
1667 aa  49.7  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3592  hypothetical protein  38.3 
 
 
743 aa  49.3  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.348874 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  32.24 
 
 
734 aa  49.7  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2919  hypothetical protein  35.65 
 
 
338 aa  48.9  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000462284  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2604  Fibronectin type III domain protein  35.53 
 
 
1302 aa  49.3  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.178054  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2143  cytochrome c family protein  51.02 
 
 
310 aa  48.1  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000152859  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  31.18 
 
 
1150 aa  47.4  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  32.94 
 
 
1565 aa  46.6  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4679  PKD domain-containing protein  41.33 
 
 
1367 aa  47  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  39.39 
 
 
623 aa  46.2  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  31.85 
 
 
428 aa  46.2  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.640976 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0292  parallel beta-helix repeat-containing protein  37.93 
 
 
463 aa  46.6  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2390  Carbohydrate-binding family V/XII  47.37 
 
 
523 aa  45.8  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.254143  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1851  hypothetical protein  42.42 
 
 
265 aa  45.4  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  39.68 
 
 
943 aa  45.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  32.37 
 
 
1771 aa  44.7  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5086  hypothetical protein  30.63 
 
 
421 aa  44.7  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  32.58 
 
 
1394 aa  44.3  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1255  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  37.7 
 
 
601 aa  44.3  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2672  glycosy hydrolase family protein  37.5 
 
 
1193 aa  43.9  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>