22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3418 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3418  hypothetical protein  100 
 
 		 611 aa  1222    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00172451  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0621  hypothetical protein  34.94 
 
 		 572 aa  260  6e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0112411  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3334  hypothetical protein  25.17 
 
 		 595 aa  100  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000666243  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2329  cytochrome c family protein  38.01 
 
 		 442 aa  92.4  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0504  cell wall surface anchor family protein, putative  37.87 
 
 		 667 aa  89.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1881  cytochrome c family protein  37.28 
 
 		 510 aa  88.2  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3662  cell wall surface anchor family protein, putative  38.1 
 
 		 659 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1851  hypothetical protein  32.93 
 
 		 265 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1761  cytochrome c family protein  34.86 
 
 		 511 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0745977  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2022  fibronectin, type III domain-containing protein  30.93 
 
 		 683 aa  71.2  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00638663  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5050  hypothetical protein  34.94 
 
 		 700 aa  62.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.567325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1402  hypothetical protein  35.5 
 
 		 698 aa  62.4  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.863964  normal  0.205205 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2143  cytochrome c family protein  32.69 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000152859  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3844  hypothetical protein  33.66 
 
 		 694 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0528  hypothetical protein  24.61 
 
 		 606 aa  57.4  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0627546  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1860  hypothetical protein  32.4 
 
 		 546 aa  55.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0230  hypothetical protein  26.91 
 
 		 653 aa  54.7  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0085  hypothetical protein  31.66 
 
 		 546 aa  54.3  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1742  hypothetical protein  33.59 
 
 		 231 aa  53.5  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0658117  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  27.17 
 
 		 692 aa  52.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2038  lipoprotein, putative  29.5 
 
 		 247 aa  47  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000251498 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0370  hypothetical protein  29.7 
 
 		 525 aa  44.3  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>