14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1742 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1742  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  470  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0658117  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2329  cytochrome c family protein  42.98 
 
 		 442 aa  105  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1881  cytochrome c family protein  41.32 
 
 		 510 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3334  hypothetical protein  46.9 
 
 		 595 aa  95.9  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000666243  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2022  fibronectin, type III domain-containing protein  46.79 
 
 		 683 aa  90.5  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00638663  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1761  cytochrome c family protein  49.07 
 
 		 511 aa  89  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0745977  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  37.72 
 
 		 692 aa  78.6  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1851  hypothetical protein  43.12 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2143  cytochrome c family protein  32.52 
 
 		 310 aa  55.1  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000152859  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3418  hypothetical protein  33.59 
 
 		 611 aa  53.9  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00172451  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1402  hypothetical protein  30.58 
 
 		 698 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.863964  normal  0.205205 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0621  hypothetical protein  22 
 
 		 572 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0112411  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5050  hypothetical protein  30.28 
 
 		 700 aa  43.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.567325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3844  hypothetical protein  27.52 
 
 		 694 aa  42.7  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>