37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2329 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2329  cytochrome c family protein  100 
 
 		 442 aa  884    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1881  cytochrome c family protein  73.14 
 
 		 510 aa  645    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1761  cytochrome c family protein  43.26 
 
 		 511 aa  233  5e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0745977  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2022  fibronectin, type III domain-containing protein  53.16 
 
 		 683 aa  212  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00638663  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  45.59 
 
 		 692 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1851  hypothetical protein  37.71 
 
 		 265 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3334  hypothetical protein  39.04 
 
 		 595 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000666243  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1742  hypothetical protein  36.47 
 
 		 231 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0658117  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2143  cytochrome c family protein  34.45 
 
 		 310 aa  99.8  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000152859  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0621  hypothetical protein  38.89 
 
 		 572 aa  95.1  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0112411  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3418  hypothetical protein  38.01 
 
 		 611 aa  92.4  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00172451  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0534  hypothetical protein  71.7 
 
 		 182 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0706  hypothetical protein  50 
 
 		 553 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.31357  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1826  cytochrome C family protein  51.35 
 
 		 1645 aa  73.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5050  hypothetical protein  38.76 
 
 		 700 aa  70.9  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.567325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2815  cytochrome c like protein  38.89 
 
 		 457 aa  67.4  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1191  hypothetical protein  68 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3844  hypothetical protein  33.91 
 
 		 694 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2903  cytochrome C family protein  36.26 
 
 		 455 aa  63.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2185  fibronectin, type III  53.09 
 
 		 656 aa  63.5  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0292079  hitchhiker  0.000132126 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2997  cytochrome C family protein  37.5 
 
 		 455 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.742851  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1860  hypothetical protein  32.64 
 
 		 546 aa  60.1  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1402  hypothetical protein  32.68 
 
 		 698 aa  58.2  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.863964  normal  0.205205 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0504  cell wall surface anchor family protein, putative  30.11 
 
 		 667 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0085  hypothetical protein  35.19 
 
 		 546 aa  57  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0528  hypothetical protein  25.38 
 
 		 606 aa  52.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0627546  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1087  cytochrome c family protein, putative  45.16 
 
 		 148 aa  49.7  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000224784  hitchhiker  0.0000155568 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2712  hypothetical protein  30.68 
 
 		 519 aa  48.9  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0370  hypothetical protein  28.79 
 
 		 525 aa  47.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2762  cytochrome C family protein  34.88 
 
 		 454 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3174  cytochrome C family protein  38.82 
 
 		 1329 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246364  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3268  cytochrome C family protein  38.82 
 
 		 1329 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3077  multihaem cytochrome  41.18 
 
 		 1330 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2515  cytochrome c family protein, putative  45.76 
 
 		 141 aa  45.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.235235  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0230  hypothetical protein  31.6 
 
 		 653 aa  43.5  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2794  hypothetical protein  39.05 
 
 		 238 aa  43.1  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3662  cell wall surface anchor family protein, putative  27.98 
 
 		 659 aa  43.1  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>