24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1851 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1851  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  519  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  39.42 
 
 		 692 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2329  cytochrome c family protein  43.33 
 
 		 442 aa  145  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1881  cytochrome c family protein  44.57 
 
 		 510 aa  142  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2022  fibronectin, type III domain-containing protein  42.26 
 
 		 683 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00638663  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1761  cytochrome c family protein  43.75 
 
 		 511 aa  126  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0745977  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2143  cytochrome c family protein  35.04 
 
 		 310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000152859  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3334  hypothetical protein  35.8 
 
 		 595 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000666243  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0621  hypothetical protein  35.98 
 
 		 572 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0112411  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1742  hypothetical protein  43.12 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0658117  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3418  hypothetical protein  34.05 
 
 		 611 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00172451  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3844  hypothetical protein  29.33 
 
 		 694 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5050  hypothetical protein  32.92 
 
 		 700 aa  52.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.567325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3595  kelch domain-containing protein  57.45 
 
 		 833 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.066444 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0528  hypothetical protein  28.5 
 
 		 606 aa  51.2  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0627546  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0504  cell wall surface anchor family protein, putative  30.9 
 
 		 667 aa  50.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3516  hypothetical protein  56 
 
 		 691 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.716202  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1402  hypothetical protein  31.07 
 
 		 698 aa  46.2  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.863964  normal  0.205205 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2960  PKD domain containing protein  42.42 
 
 		 687 aa  45.4  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2757  Ig domain protein group 2 domain protein  60.47 
 
 		 332 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2662  Ig domain protein group 2 domain protein  60.47 
 
 		 332 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10701  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2774  hypothetical protein  48 
 
 		 691 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134072  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2773  fibronectin, type III  46.67 
 
 		 1115 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3662  cell wall surface anchor family protein, putative  27.64 
 
 		 659 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>