215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2022 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2022  fibronectin, type III domain-containing protein  100 
 
 
683 aa  1325    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00638663  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  59.72 
 
 
692 aa  634  1e-180  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2185  fibronectin, type III  64.46 
 
 
656 aa  365  2e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0292079  hitchhiker  0.000132126 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2329  cytochrome c family protein  52.43 
 
 
442 aa  212  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1881  cytochrome c family protein  51.6 
 
 
510 aa  208  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1543  cellulosome anchoring protein cohesin region  32.57 
 
 
782 aa  173  9e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000430269  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1761  cytochrome c family protein  50 
 
 
511 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0745977  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.97 
 
 
795 aa  141  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  34.39 
 
 
1628 aa  139  1e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1851  hypothetical protein  42.26 
 
 
265 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  42.13 
 
 
1067 aa  124  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  36.8 
 
 
1462 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3334  hypothetical protein  42.77 
 
 
595 aa  114  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000666243  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  41.55 
 
 
1199 aa  110  7.000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  33.1 
 
 
9585 aa  110  9.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2143  cytochrome c family protein  33.63 
 
 
310 aa  107  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000152859  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  30.77 
 
 
480 aa  99.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  28.39 
 
 
2068 aa  92.8  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1793  fibronectin type III domain-containing protein  48.35 
 
 
224 aa  91.3  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0381  Fibronectin type III domain protein  51 
 
 
277 aa  90.5  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  45.05 
 
 
648 aa  90.1  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5537  Fibronectin type III domain protein  34.13 
 
 
744 aa  89.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320231  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1742  hypothetical protein  48.11 
 
 
231 aa  89.7  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0658117  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0363  Fibronectin type III domain protein  60.81 
 
 
278 aa  89.4  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00588673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  42.31 
 
 
680 aa  89  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  40.58 
 
 
3802 aa  87.4  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5269  Fibronectin type III domain protein  34.47 
 
 
1633 aa  86.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.803528  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1314  Fibronectin type III domain protein  43.09 
 
 
211 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000146829  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0621  hypothetical protein  35.91 
 
 
572 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0112411  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3156  Fibronectin type III domain protein  27.96 
 
 
741 aa  84.3  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2403  PA14 domain protein  29.5 
 
 
1172 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0648  Fibronectin type III domain protein  30.27 
 
 
1795 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.034686  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  29.27 
 
 
1307 aa  79.3  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  28.31 
 
 
2334 aa  79.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  25.93 
 
 
2170 aa  79  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1552  fibronectin type III domain-containing protein  25.07 
 
 
1131 aa  78.2  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0138471  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  43.09 
 
 
613 aa  78.6  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  32.48 
 
 
2286 aa  78.2  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1632  Fibronectin type III domain protein  26.87 
 
 
377 aa  77.8  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  26.52 
 
 
3027 aa  75.9  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  30.5 
 
 
1363 aa  76.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.24 
 
 
649 aa  75.9  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  31.15 
 
 
1363 aa  75.1  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  26.75 
 
 
903 aa  74.7  0.000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  24.64 
 
 
6885 aa  74.3  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  32.47 
 
 
2286 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  33 
 
 
3333 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0706  hypothetical protein  56.67 
 
 
553 aa  72  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.31357  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  27.37 
 
 
680 aa  72  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3418  hypothetical protein  30.93 
 
 
611 aa  71.6  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00172451  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  24.4 
 
 
667 aa  71.2  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1817  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.7 
 
 
1787 aa  71.6  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.29404 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  40.09 
 
 
1160 aa  70.9  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1004  von Willebrand factor type D protein  42.57 
 
 
2998 aa  70.9  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1100  FG-GAP repeat protein  32.37 
 
 
1065 aa  70.9  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  29.41 
 
 
1380 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0534  hypothetical protein  62.5 
 
 
182 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1191  hypothetical protein  66.67 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0017  fibronectin type III domain protein  27.78 
 
 
207 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.857049  normal  0.0757173 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  32.26 
 
 
918 aa  67  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  26.02 
 
 
1401 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  26.12 
 
 
803 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0640  Fibronectin type III domain protein  25.63 
 
 
404 aa  66.6  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0896  Fibronectin type III domain protein  27.3 
 
 
804 aa  65.9  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5050  hypothetical protein  36.63 
 
 
700 aa  65.5  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.567325  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3674  Fibronectin type III domain protein  33.95 
 
 
484 aa  65.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.457522  hitchhiker  0.000917339 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  37.33 
 
 
2042 aa  65.9  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  48.57 
 
 
492 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.381426  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05360  fibronectin type 3 domain-containing protein  32.52 
 
 
1880 aa  64.3  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1330  Fibronectin type III domain protein  31.13 
 
 
2056 aa  63.5  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000696723 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  32.45 
 
 
4429 aa  63.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1087  cytochrome c family protein, putative  50 
 
 
148 aa  63.5  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000224784  hitchhiker  0.0000155568 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  29.02 
 
 
1221 aa  63.5  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  25.54 
 
 
1401 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  28.8 
 
 
3507 aa  62.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  36.84 
 
 
743 aa  62  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2202  fibronectin type III domain-containing protein  30.81 
 
 
841 aa  62.4  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536559 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1569  helix-turn-helix, AraC type  29.41 
 
 
1113 aa  62  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0610  fibronectin type III domain protein  23.54 
 
 
404 aa  61.6  0.00000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6593  fibronectin type III domain-containing protein  29.87 
 
 
428 aa  61.2  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21610  fibronectin type III domain-containing protein  30.03 
 
 
2084 aa  61.2  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0529  fibronectin, type III domain-containing protein  33.55 
 
 
448 aa  60.8  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009673  Bcer98_4034  fibronectin type III domain-containing protein  24.64 
 
 
454 aa  60.8  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2911  fibronectin, type III domain-containing protein  28.42 
 
 
864 aa  60.8  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4818  Fibronectin type III domain protein  28.92 
 
 
2069 aa  60.1  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  31 
 
 
999 aa  60.1  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2515  cytochrome c family protein, putative  44.59 
 
 
141 aa  59.3  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.235235  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  30.69 
 
 
598 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  31.8 
 
 
1973 aa  59.7  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3844  hypothetical protein  34.62 
 
 
694 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  35.29 
 
 
409 aa  59.7  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  38.6 
 
 
918 aa  58.9  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  30.57 
 
 
455 aa  58.2  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  30.57 
 
 
455 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2198  Fibronectin type III domain protein  33.9 
 
 
2047 aa  58.5  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0185742 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1295  fibronectin type III domain-containing protein  24.78 
 
 
410 aa  58.5  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0068  fibronectin, type III domain-containing protein  31.92 
 
 
1695 aa  58.2  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0824  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  48.86 
 
 
492 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0168099  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1547  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  46.88 
 
 
492 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1570  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase precursor  48.86 
 
 
492 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>