67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3674 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3674  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 
484 aa  976    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.457522  hitchhiker  0.000917339 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  36.82 
 
 
1004 aa  77.4  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  34.17 
 
 
1887 aa  70.5  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2388  Fibronectin type III domain protein  33.78 
 
 
768 aa  70.5  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52789  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.73 
 
 
729 aa  68.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  29.67 
 
 
456 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  28.3 
 
 
456 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  28.12 
 
 
459 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3541  hypothetical protein  38.32 
 
 
137 aa  63.9  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  29.06 
 
 
455 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  28.5 
 
 
458 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  28.43 
 
 
455 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  31.13 
 
 
762 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  31.03 
 
 
680 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  28.16 
 
 
455 aa  60.8  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  32.73 
 
 
1221 aa  60.5  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  30.49 
 
 
2286 aa  59.3  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30 
 
 
809 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  28.24 
 
 
455 aa  59.3  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  27.67 
 
 
455 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  27.67 
 
 
455 aa  57  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  32.31 
 
 
692 aa  57  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  31.25 
 
 
743 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  29.13 
 
 
938 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  27.18 
 
 
455 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  26.76 
 
 
455 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  26.94 
 
 
455 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  26.94 
 
 
455 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0920  hypothetical protein  37.61 
 
 
148 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  27.46 
 
 
458 aa  54.3  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  31.47 
 
 
997 aa  53.9  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0974  hypothetical protein  36.7 
 
 
147 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  29.13 
 
 
455 aa  53.9  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  35.16 
 
 
1462 aa  52.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2834  glycosyl hydrolase-like  28.17 
 
 
1238 aa  52.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00529602  normal  0.0523238 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0971  hypothetical protein  36.7 
 
 
147 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.190986  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2022  fibronectin, type III domain-containing protein  34.22 
 
 
683 aa  51.6  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00638663  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1446  fibronectin, type III domain-containing protein  26.81 
 
 
1089 aa  51.6  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  30.92 
 
 
973 aa  50.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1151  protein of unknown function DUF1549  28.12 
 
 
1737 aa  50.1  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0030  exported nucleotide-binding protein  35.29 
 
 
696 aa  50.1  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0249  hypothetical protein  30.63 
 
 
454 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.639683  decreased coverage  0.00118438 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  33.66 
 
 
2170 aa  49.3  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0962  hypothetical protein  35.64 
 
 
175 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.107191  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  24.82 
 
 
6885 aa  47.8  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  34.95 
 
 
651 aa  48.1  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3336  Glycosidase-like protein  35.19 
 
 
997 aa  47.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.310456  normal  0.29304 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  27.01 
 
 
1067 aa  47  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  30 
 
 
614 aa  47  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.4 
 
 
1448 aa  46.6  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0432  cellulose-binding family II  38.27 
 
 
562 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.302151 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2387  Fibronectin type III domain protein  39.53 
 
 
703 aa  45.8  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2392  Fibronectin type III domain protein  38.24 
 
 
831 aa  45.8  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0348  hypothetical protein  27.01 
 
 
131 aa  45.1  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1216  hypothetical protein  43.64 
 
 
58 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  29.5 
 
 
5743 aa  45.1  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2852  hypothetical protein  43.64 
 
 
58 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  30.89 
 
 
703 aa  44.7  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  31.1 
 
 
561 aa  44.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  28.78 
 
 
854 aa  44.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1890  protein of unknown function DUF1549  31.73 
 
 
922 aa  43.9  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2950  protein of unknown function DUF1549  28.3 
 
 
1046 aa  43.5  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.798695  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1986  hypothetical protein  33.66 
 
 
299 aa  43.5  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000747383 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1601  fibronectin, type III  33.33 
 
 
548 aa  43.1  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.751366 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1582  hypothetical protein  41.82 
 
 
55 aa  43.1  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.841071  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1767  hypothetical protein  41.82 
 
 
55 aa  43.1  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0436  hypothetical protein  41.82 
 
 
55 aa  43.1  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>