20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3844 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5050  hypothetical protein  62.61 
 
 		 700 aa  834    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.567325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3844  hypothetical protein  100 
 
 		 694 aa  1377    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4305  hypothetical protein  96.89 
 
 		 237 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1402  hypothetical protein  29.11 
 
 		 698 aa  123  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.863964  normal  0.205205 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3662  cell wall surface anchor family protein, putative  27.59 
 
 		 659 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0085  hypothetical protein  35 
 
 		 546 aa  74.7  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5016  hypothetical protein  28.38 
 
 		 706 aa  72.8  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276526  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3334  hypothetical protein  34.38 
 
 		 595 aa  71.6  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000666243  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0230  hypothetical protein  28.79 
 
 		 653 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0504  cell wall surface anchor family protein, putative  25.45 
 
 		 667 aa  67  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2329  cytochrome c family protein  33.91 
 
 		 442 aa  64.3  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1881  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 510 aa  60.8  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2022  fibronectin, type III domain-containing protein  33.8 
 
 		 683 aa  59.7  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00638663  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3418  hypothetical protein  33.66 
 
 		 611 aa  58.2  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00172451  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1851  hypothetical protein  29.56 
 
 		 265 aa  55.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0621  hypothetical protein  34.29 
 
 		 572 aa  54.7  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0112411  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2143  cytochrome c family protein  32.06 
 
 		 310 aa  53.5  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000152859  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1761  cytochrome c family protein  31.33 
 
 		 511 aa  51.2  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0745977  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  31.5 
 
 		 692 aa  48.1  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1860  hypothetical protein  31.25 
 
 		 546 aa  47.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>