35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1881 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1881  cytochrome c family protein  100 
 
 		 510 aa  1011    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2329  cytochrome c family protein  68.63 
 
 		 442 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1761  cytochrome c family protein  43.82 
 
 		 511 aa  231  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0745977  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2022  fibronectin, type III domain-containing protein  50.89 
 
 		 683 aa  209  7e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00638663  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  46.34 
 
 		 692 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1851  hypothetical protein  44.57 
 
 		 265 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3334  hypothetical protein  39.13 
 
 		 595 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000666243  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1742  hypothetical protein  41.32 
 
 		 231 aa  99.8  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0658117  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2143  cytochrome c family protein  35.58 
 
 		 310 aa  97.4  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000152859  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0621  hypothetical protein  36.67 
 
 		 572 aa  89  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0112411  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3418  hypothetical protein  37.28 
 
 		 611 aa  87.8  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00172451  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0706  hypothetical protein  52.88 
 
 		 553 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.31357  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1826  cytochrome C family protein  52.7 
 
 		 1645 aa  77.4  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0534  hypothetical protein  67.92 
 
 		 182 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1191  hypothetical protein  68 
 
 		 184 aa  67.8  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2815  cytochrome c like protein  40.66 
 
 		 457 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2185  fibronectin, type III  63.79 
 
 		 656 aa  65.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0292079  hitchhiker  0.000132126 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2903  cytochrome C family protein  38.46 
 
 		 455 aa  63.9  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5050  hypothetical protein  35.09 
 
 		 700 aa  62.4  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.567325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2997  cytochrome C family protein  40 
 
 		 455 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.742851  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3844  hypothetical protein  33.15 
 
 		 694 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0504  cell wall surface anchor family protein, putative  31.15 
 
 		 667 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1402  hypothetical protein  34.11 
 
 		 698 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.863964  normal  0.205205 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1860  hypothetical protein  29.78 
 
 		 546 aa  58.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0528  hypothetical protein  27.27 
 
 		 606 aa  57  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0627546  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0085  hypothetical protein  33.77 
 
 		 546 aa  50.4  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1087  cytochrome c family protein, putative  49.12 
 
 		 148 aa  49.3  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000224784  hitchhiker  0.0000155568 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2762  cytochrome C family protein  33.75 
 
 		 454 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3268  cytochrome C family protein  40.51 
 
 		 1329 aa  47.4  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3174  cytochrome C family protein  40.51 
 
 		 1329 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246364  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3077  multihaem cytochrome  39.53 
 
 		 1330 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0370  hypothetical protein  31.29 
 
 		 525 aa  45.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2712  hypothetical protein  29.07 
 
 		 519 aa  44.3  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1823  cytochrome C family protein  42.7 
 
 		 1525 aa  43.9  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2515  cytochrome c family protein, putative  45.61 
 
 		 141 aa  43.5  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.235235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>