30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0534 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0534  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  347  5e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1191  hypothetical protein  40.62 
 
 		 184 aa  108  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1881  cytochrome c family protein  60 
 
 		 510 aa  84.3  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2329  cytochrome c family protein  73.08 
 
 		 442 aa  84.3  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2185  fibronectin, type III  52.63 
 
 		 656 aa  68.6  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0292079  hitchhiker  0.000132126 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1761  cytochrome c family protein  51.67 
 
 		 511 aa  58.5  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0745977  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0706  hypothetical protein  50.88 
 
 		 553 aa  57.8  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.31357  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2022  fibronectin, type III domain-containing protein  59.18 
 
 		 683 aa  56.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00638663  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2515  cytochrome c family protein, putative  31.25 
 
 		 141 aa  49.7  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.235235  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1087  cytochrome c family protein, putative  37.8 
 
 		 148 aa  49.3  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000224784  hitchhiker  0.0000155568 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  36.54 
 
 		 667 aa  47.4  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  55.56 
 
 		 555 aa  47  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  41.67 
 
 		 268 aa  47  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45679  predicted protein  45.59 
 
 		 682 aa  46.2  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44995  predicted protein  56.14 
 
 		 1217 aa  45.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00833272  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.33 
 
 		 1162 aa  45.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  29.7 
 
 		 444 aa  45.1  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  34.02 
 
 		 407 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  40.3 
 
 		 1281 aa  44.7  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  57.89 
 
 		 840 aa  44.7  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45068  predicted protein  34.29 
 
 		 479 aa  43.9  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  34.48 
 
 		 1000 aa  43.5  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  40 
 
 		 433 aa  43.5  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.19 
 
 		 257 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4840  hypothetical protein  53.57 
 
 		 908 aa  42.4  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191443  hitchhiker  0.00180703 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3800  heat shock protein 70  43.86 
 
 		 880 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.122258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.97 
 
 		 261 aa  42  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  32.56 
 
 		 458 aa  42  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  46.15 
 
 		 671 aa  41.6  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  46.81 
 
 		 489 aa  40.8  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>