47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45679 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_45679  predicted protein  100 
 
 
682 aa  1357    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45682  predicted protein  49.2 
 
 
633 aa  579  1e-164  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49666  predicted protein  36.72 
 
 
540 aa  219  2e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49670  predicted protein  32.21 
 
 
454 aa  174  3.9999999999999995e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.151645  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49671  predicted protein  32.21 
 
 
454 aa  173  9e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.245553  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45913  predicted protein  27.42 
 
 
1012 aa  105  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  27.02 
 
 
1000 aa  102  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39117  predicted protein  26.26 
 
 
587 aa  100  8e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.294419  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39088  predicted protein  25.7 
 
 
685 aa  100  8e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.876501  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46212  predicted protein  29.64 
 
 
768 aa  99  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44263  predicted protein  27.32 
 
 
1017 aa  96.7  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243046  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46346  predicted protein  25.06 
 
 
716 aa  90.5  9e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0737232  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43724  predicted protein  23.34 
 
 
890 aa  88.2  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0602  two component regulator  31.94 
 
 
2491 aa  79  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49769  predicted protein  25.39 
 
 
593 aa  77  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44441  predicted protein  21.58 
 
 
4500 aa  75.5  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_4339  predicted protein  27.73 
 
 
222 aa  72.8  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00625498  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_49989  predicted protein  29.25 
 
 
1498 aa  73.2  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32267  predicted protein  25.4 
 
 
640 aa  72  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38108  predicted protein  25.71 
 
 
461 aa  68.9  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12927  predicted protein  27.94 
 
 
526 aa  68.2  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44315  predicted protein  24.76 
 
 
348 aa  67  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.205581  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16261  predicted protein  28.12 
 
 
249 aa  65.1  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12909  predicted protein  34.65 
 
 
258 aa  65.1  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_107  predicted protein  28.63 
 
 
601 aa  63.9  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.799153  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2739  predicted protein  29.08 
 
 
230 aa  61.6  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_3656  predicted protein  28.32 
 
 
247 aa  61.6  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  37.75 
 
 
840 aa  58.9  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_2593  predicted protein  29.28 
 
 
304 aa  58.5  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11793  predicted protein  26.32 
 
 
263 aa  58.5  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.601681  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_1379  predicted protein  26.55 
 
 
350 aa  55.1  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.815814  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_1196  predicted protein  28.09 
 
 
304 aa  54.3  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.51359  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11423  predicted protein  25 
 
 
168 aa  53.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.335216  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12550  predicted protein  26.83 
 
 
283 aa  52.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  27.68 
 
 
482 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_1389  predicted protein  30 
 
 
334 aa  51.2  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000000337906  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  42.52 
 
 
555 aa  50.8  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_1531  predicted protein  27.14 
 
 
447 aa  49.7  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.486556  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  39.86 
 
 
916 aa  48.5  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44011  predicted protein  24.86 
 
 
899 aa  48.1  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0173538  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33901  predicted protein  23.67 
 
 
596 aa  47  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.530565  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44995  predicted protein  45.12 
 
 
1217 aa  46.2  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00833272  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  28.49 
 
 
757 aa  46.2  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47315  predicted protein  37.29 
 
 
504 aa  44.7  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151566  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  28.03 
 
 
416 aa  44.3  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48494  predicted protein  38.33 
 
 
582 aa  43.9  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.078765  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  35.47 
 
 
1394 aa  43.9  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>