27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1761 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1761  cytochrome c family protein  100 
 
 		 511 aa  990    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0745977  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1881  cytochrome c family protein  40.98 
 
 		 510 aa  252  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2329  cytochrome c family protein  43.09 
 
 		 442 aa  237  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2022  fibronectin, type III domain-containing protein  50.53 
 
 		 683 aa  186  9e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00638663  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  46.15 
 
 		 692 aa  167  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0706  hypothetical protein  42.58 
 
 		 553 aa  151  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.31357  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1851  hypothetical protein  43.75 
 
 		 265 aa  134  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3334  hypothetical protein  38.54 
 
 		 595 aa  111  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000666243  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2143  cytochrome c family protein  35.32 
 
 		 310 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000152859  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0621  hypothetical protein  35.19 
 
 		 572 aa  99.8  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0112411  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1742  hypothetical protein  49.07 
 
 		 231 aa  98.2  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0658117  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3418  hypothetical protein  34.13 
 
 		 611 aa  83.6  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00172451  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2185  fibronectin, type III  61.29 
 
 		 656 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0292079  hitchhiker  0.000132126 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0504  cell wall surface anchor family protein, putative  34.05 
 
 		 667 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5050  hypothetical protein  37.42 
 
 		 700 aa  61.6  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.567325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1402  hypothetical protein  33.33 
 
 		 698 aa  59.7  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.863964  normal  0.205205 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3662  cell wall surface anchor family protein, putative  35.94 
 
 		 659 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1087  cytochrome c family protein, putative  40.74 
 
 		 148 aa  58.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000224784  hitchhiker  0.0000155568 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3844  hypothetical protein  32.74 
 
 		 694 aa  57  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2515  cytochrome c family protein, putative  46.67 
 
 		 141 aa  53.5  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.235235  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0534  hypothetical protein  50.91 
 
 		 182 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1191  hypothetical protein  57.14 
 
 		 184 aa  52  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0085  hypothetical protein  34.17 
 
 		 546 aa  50.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0230  hypothetical protein  32.2 
 
 		 653 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1860  hypothetical protein  33.17 
 
 		 546 aa  44.3  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3777  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.42 
 
 		 408 aa  43.9  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0155235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2583  cytochrome c class I  47.56 
 
 		 407 aa  43.5  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>