158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2185 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2185  fibronectin, type III  100 
 
 
656 aa  1284    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0292079  hitchhiker  0.000132126 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2022  fibronectin, type III domain-containing protein  62.72 
 
 
683 aa  343  4e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00638663  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  54.25 
 
 
692 aa  265  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0706  hypothetical protein  41.34 
 
 
553 aa  164  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.31357  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1543  cellulosome anchoring protein cohesin region  41.29 
 
 
782 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000430269  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0235  hypothetical protein  33.95 
 
 
486 aa  135  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0416653  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  43.24 
 
 
1067 aa  125  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  34.64 
 
 
1628 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  42.23 
 
 
1199 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  34.17 
 
 
9585 aa  111  5e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3452  hypothetical protein  33.66 
 
 
407 aa  107  8e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.149809  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.32 
 
 
795 aa  106  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2832  hypothetical protein  32.86 
 
 
465 aa  102  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.907997  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0381  Fibronectin type III domain protein  50.53 
 
 
277 aa  89.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1793  fibronectin type III domain-containing protein  50.51 
 
 
224 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0363  Fibronectin type III domain protein  55.13 
 
 
278 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00588673 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0896  Fibronectin type III domain protein  29.39 
 
 
804 aa  84  0.000000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  31.79 
 
 
2068 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  28.57 
 
 
3027 aa  80.9  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1761  cytochrome c family protein  61.29 
 
 
511 aa  80.5  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0745977  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  34.24 
 
 
480 aa  79.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  33.91 
 
 
2286 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5537  Fibronectin type III domain protein  38.16 
 
 
744 aa  77.8  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320231  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1552  fibronectin type III domain-containing protein  27.08 
 
 
1131 aa  76.3  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0138471  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  39.22 
 
 
3802 aa  76.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1228  hypothetical protein  30.69 
 
 
524 aa  75.5  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.150843  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  36.45 
 
 
648 aa  75.5  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.25 
 
 
649 aa  73.9  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2403  PA14 domain protein  27.99 
 
 
1172 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1314  Fibronectin type III domain protein  34.86 
 
 
211 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000146829  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  26.5 
 
 
903 aa  72  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1004  von Willebrand factor type D protein  45.63 
 
 
2998 aa  71.2  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3019  hypothetical protein  25.73 
 
 
476 aa  70.9  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1330  Fibronectin type III domain protein  30.69 
 
 
2056 aa  70.9  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000696723 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  32.78 
 
 
1462 aa  70.9  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0648  Fibronectin type III domain protein  28.32 
 
 
1795 aa  70.5  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.034686  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3361  hypothetical protein  28.77 
 
 
466 aa  69.7  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623188  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1632  Fibronectin type III domain protein  26.06 
 
 
377 aa  68.9  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3156  Fibronectin type III domain protein  30.52 
 
 
741 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6593  fibronectin type III domain-containing protein  32.25 
 
 
428 aa  68.2  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1585  hypothetical protein  28.4 
 
 
405 aa  68.2  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000305006  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0068  fibronectin, type III domain-containing protein  35.75 
 
 
1695 aa  68.2  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0534  hypothetical protein  59.65 
 
 
182 aa  67.8  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4011  hypothetical protein  27.33 
 
 
390 aa  67.4  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  29.82 
 
 
2170 aa  67  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  37.2 
 
 
2042 aa  65.1  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1881  cytochrome c family protein  63.79 
 
 
510 aa  65.1  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0027  Fibronectin type III domain protein  56.32 
 
 
460 aa  64.7  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  38.79 
 
 
1160 aa  64.7  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  34.78 
 
 
1550 aa  63.5  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2329  cytochrome c family protein  60.34 
 
 
442 aa  62  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2003  Fibronectin type III domain protein  32.39 
 
 
725 aa  61.6  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333921  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  27.78 
 
 
680 aa  61.2  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1817  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.82 
 
 
1787 aa  60.8  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.29404 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  40.5 
 
 
1847 aa  60.8  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1087  cytochrome c family protein, putative  49.28 
 
 
148 aa  60.1  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000224784  hitchhiker  0.0000155568 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0017  fibronectin type III domain protein  26.01 
 
 
207 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.857049  normal  0.0757173 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1748  hypothetical protein  26.24 
 
 
413 aa  60.5  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000762917  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  31.27 
 
 
1363 aa  60.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  24.6 
 
 
6885 aa  60.1  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  32.87 
 
 
680 aa  58.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  30.88 
 
 
1363 aa  58.9  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2515  cytochrome c family protein, putative  45.95 
 
 
141 aa  58.5  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.235235  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1759  Fibronectin type III domain protein  33.47 
 
 
2067 aa  57.8  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.77836  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  32 
 
 
3333 aa  57.4  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1286  fibronectin, type III domain-containing protein  29.63 
 
 
2051 aa  57.4  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2675  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  37.69 
 
 
834 aa  57.4  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.343316 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1037  hypothetical protein  31.79 
 
 
409 aa  57.4  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0570191 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  42.35 
 
 
1401 aa  57.4  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21610  fibronectin type III domain-containing protein  32.29 
 
 
2084 aa  56.6  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  33.33 
 
 
717 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  30.95 
 
 
445 aa  55.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05360  fibronectin type 3 domain-containing protein  34.5 
 
 
1880 aa  55.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3016  hypothetical protein  26.24 
 
 
500 aa  56.2  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0529  fibronectin, type III domain-containing protein  34.44 
 
 
448 aa  55.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0427  Fibronectin type III domain protein  29.79 
 
 
2039 aa  56.6  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0611  hypothetical protein  29.82 
 
 
438 aa  55.5  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.236584  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  29.41 
 
 
918 aa  55.5  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0762  hypothetical protein  29.82 
 
 
415 aa  55.8  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  27.55 
 
 
803 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  25.11 
 
 
455 aa  54.7  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1191  hypothetical protein  53.7 
 
 
184 aa  54.7  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  25.11 
 
 
455 aa  54.7  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  37.37 
 
 
1401 aa  55.1  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1295  fibronectin type III domain-containing protein  20.22 
 
 
410 aa  54.3  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  26.07 
 
 
667 aa  54.3  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1415  fibronectin type III domain-containing protein  20.58 
 
 
410 aa  53.5  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0606  hypothetical protein  28.08 
 
 
421 aa  53.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.565988  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4221  hypothetical protein  31.33 
 
 
571 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.583626 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  25.56 
 
 
455 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1195  hypothetical protein  31.33 
 
 
572 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.91759  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  34.8 
 
 
2522 aa  52.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05620  fibronectin type III domain-containing protein  33.68 
 
 
2052 aa  52.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.691963  normal  0.30022 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  31.02 
 
 
1380 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  25.5 
 
 
1307 aa  52.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0201  hypothetical protein  28.96 
 
 
429 aa  52.8  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.640363  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1226  hypothetical protein  31.33 
 
 
572 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.342125  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0938  hypothetical protein  31.33 
 
 
418 aa  52.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04176  exoglucanase A  42.16 
 
 
548 aa  53.1  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0957  hypothetical protein  32.99 
 
 
1994 aa  53.1  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.736873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>