16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3361 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_4011  hypothetical protein  97.15 
 
 
390 aa  661    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3361  hypothetical protein  100 
 
 
466 aa  886    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623188  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2832  hypothetical protein  37.84 
 
 
465 aa  172  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.907997  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3452  hypothetical protein  33.75 
 
 
407 aa  91.7  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.149809  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0706  hypothetical protein  28.73 
 
 
553 aa  88.6  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.31357  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0235  hypothetical protein  28.25 
 
 
486 aa  64.3  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0416653  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2573  hypothetical protein  31.01 
 
 
523 aa  62  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000703418 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1228  hypothetical protein  25.06 
 
 
524 aa  60.8  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.150843  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1960  hypothetical protein  55.93 
 
 
325 aa  52  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1037  hypothetical protein  26.71 
 
 
409 aa  49.3  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0570191 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2185  fibronectin, type III  30.98 
 
 
656 aa  48.9  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0292079  hitchhiker  0.000132126 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0330  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.89 
 
 
792 aa  46.6  0.0009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1585  hypothetical protein  28.65 
 
 
405 aa  46.6  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000305006  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0233  hypothetical protein  33.01 
 
 
780 aa  44.3  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.9097 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3984  hypothetical protein  37.84 
 
 
742 aa  44.3  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.580722  hitchhiker  0.00476383 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2985  Radical SAM domain protein  32.46 
 
 
771 aa  43.9  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.5382 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>