28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1228 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1228  hypothetical protein  100 
 
 		 524 aa  1032    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.150843  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3452  hypothetical protein  32.07 
 
 		 407 aa  103  7e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.149809  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2832  hypothetical protein  30.77 
 
 		 465 aa  98.2  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.907997  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1585  hypothetical protein  29.17 
 
 		 405 aa  94.4  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000305006  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3019  hypothetical protein  29.02 
 
 		 476 aa  83.2  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0235  hypothetical protein  27.06 
 
 		 486 aa  81.6  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0416653  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0706  hypothetical protein  33.12 
 
 		 553 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.31357  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4011  hypothetical protein  30.77 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2185  fibronectin, type III  33.74 
 
 		 656 aa  72  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0292079  hitchhiker  0.000132126 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3361  hypothetical protein  28.05 
 
 		 466 aa  68.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623188  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2573  hypothetical protein  28.4 
 
 		 523 aa  63.9  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000703418 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0938  hypothetical protein  29.19 
 
 		 418 aa  62.4  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3016  hypothetical protein  26.4 
 
 		 500 aa  62.4  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6702  hypothetical protein  28.51 
 
 		 423 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5246  hypothetical protein  28.68 
 
 		 357 aa  53.9  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.458222 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5526  hypothetical protein  30.53 
 
 		 343 aa  53.9  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568584 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1037  hypothetical protein  26.16 
 
 		 409 aa  52.8  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0570191 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4781  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  29.22 
 
 		 438 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7050  hypothetical protein  30.3 
 
 		 391 aa  48.5  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0840  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  28.1 
 
 		 445 aa  47.8  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0336  hypothetical protein  27.81 
 
 		 404 aa  47  0.0009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0182266  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0611  hypothetical protein  27.1 
 
 		 438 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.236584  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0762  hypothetical protein  27.1 
 
 		 415 aa  45.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4636  putative lipoprotein  22.84 
 
 		 425 aa  45.4  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0201  hypothetical protein  27 
 
 		 429 aa  44.7  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.640363  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1748  hypothetical protein  27.01 
 
 		 413 aa  44.7  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000762917  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0606  hypothetical protein  26.89 
 
 		 421 aa  43.9  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.565988  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0758  hypothetical protein  26.89 
 
 		 402 aa  43.5  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.679928 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>