26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1748 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1748  hypothetical protein  100 
 
 		 413 aa  819    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000762917  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4221  hypothetical protein  31.87 
 
 		 571 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.583626 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1195  hypothetical protein  35.52 
 
 		 572 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.91759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1226  hypothetical protein  32.82 
 
 		 572 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.342125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7050  hypothetical protein  31.58 
 
 		 391 aa  87  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6702  hypothetical protein  29.35 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0762  hypothetical protein  30.39 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0611  hypothetical protein  30.39 
 
 		 438 aa  80.1  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.236584  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0229  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  30.2 
 
 		 441 aa  79.3  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6182  hypothetical protein  40.41 
 
 		 414 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0758  hypothetical protein  28.72 
 
 		 402 aa  75.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.679928 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0606  hypothetical protein  28.72 
 
 		 421 aa  75.5  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.565988  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4781  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  31.21 
 
 		 438 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3550  putative signal peptide  36.94 
 
 		 438 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.693928 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0909  hypothetical protein  29.32 
 
 		 307 aa  62  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000691301  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0235  hypothetical protein  28.51 
 
 		 486 aa  61.6  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0416653  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3452  hypothetical protein  32.42 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.149809  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0785  hypothetical protein  32 
 
 		 466 aa  57.8  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.241117  normal  0.237924 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2185  fibronectin, type III  26.64 
 
 		 656 aa  57.8  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0292079  hitchhiker  0.000132126 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0840  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  32.11 
 
 		 445 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5246  hypothetical protein  32.74 
 
 		 357 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.458222 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5526  hypothetical protein  32.74 
 
 		 343 aa  54.3  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568584 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0201  hypothetical protein  34 
 
 		 429 aa  50.8  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.640363  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0706  hypothetical protein  26.48 
 
 		 553 aa  49.7  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.31357  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1228  hypothetical protein  28.23 
 
 		 524 aa  49.7  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.150843  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4636  putative lipoprotein  22.46 
 
 		 425 aa  43.1  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>