20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0229 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0229  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  100 
 
 		 441 aa  836    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0785  hypothetical protein  47.87 
 
 		 466 aa  203  6e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.241117  normal  0.237924 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4781  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  54.1 
 
 		 438 aa  193  6e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3550  putative signal peptide  44.23 
 
 		 438 aa  186  8e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.693928 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6702  hypothetical protein  53.85 
 
 		 423 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0840  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  48.26 
 
 		 445 aa  172  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6182  hypothetical protein  50.38 
 
 		 414 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7050  hypothetical protein  40.8 
 
 		 391 aa  152  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5246  hypothetical protein  39.83 
 
 		 357 aa  98.2  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.458222 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5526  hypothetical protein  39.47 
 
 		 343 aa  94  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568584 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1748  hypothetical protein  30.2 
 
 		 413 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000762917  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0909  hypothetical protein  32.28 
 
 		 307 aa  67  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000691301  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1195  hypothetical protein  32.38 
 
 		 572 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.91759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1226  hypothetical protein  32.38 
 
 		 572 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.342125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4221  hypothetical protein  32.51 
 
 		 571 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.583626 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0762  hypothetical protein  31.34 
 
 		 415 aa  47  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0611  hypothetical protein  31.34 
 
 		 438 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.236584  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0758  hypothetical protein  30.6 
 
 		 402 aa  45.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.679928 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0606  hypothetical protein  30.6 
 
 		 421 aa  44.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.565988  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  37.23 
 
 		 2851 aa  44.7  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>