23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4221 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1195  hypothetical protein  87.97 
 
 		 572 aa  712    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.91759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1226  hypothetical protein  87.34 
 
 		 572 aa  694    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.342125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4221  hypothetical protein  100 
 
 		 571 aa  1112    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.583626 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1748  hypothetical protein  33.33 
 
 		 413 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000762917  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6702  hypothetical protein  36.8 
 
 		 423 aa  74.7  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7050  hypothetical protein  34.18 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6182  hypothetical protein  39.43 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0909  hypothetical protein  32.39 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000691301  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3452  hypothetical protein  32.45 
 
 		 407 aa  60.8  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.149809  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2185  fibronectin, type III  32.05 
 
 		 656 aa  59.7  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0292079  hitchhiker  0.000132126 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0201  hypothetical protein  33.95 
 
 		 429 aa  59.3  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.640363  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0235  hypothetical protein  29.12 
 
 		 486 aa  57.8  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0416653  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0840  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  37.39 
 
 		 445 aa  57.8  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1585  hypothetical protein  29.91 
 
 		 405 aa  54.7  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000305006  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3533  hypothetical protein  44.44 
 
 		 338 aa  53.9  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.674186  normal  0.782695 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0785  hypothetical protein  28.77 
 
 		 466 aa  53.5  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.241117  normal  0.237924 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4781  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  34.27 
 
 		 438 aa  52  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5216  OmpA/MotB domain protein  28.05 
 
 		 723 aa  50.8  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.152488 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0229  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  34.33 
 
 		 441 aa  50.1  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5291  OmpA/MotB domain protein  33.87 
 
 		 718 aa  46.6  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.550755 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4749  OmpA/MotB domain-containing protein  31.08 
 
 		 717 aa  46.6  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0350948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1228  hypothetical protein  28.07 
 
 		 524 aa  44.7  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.150843  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3395  hypothetical protein  38.71 
 
 		 308 aa  44.3  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.095217 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>