19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3550 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3550  putative signal peptide  100 
 
 		 438 aa  798    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.693928 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4781  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  54.83 
 
 		 438 aa  216  7e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0785  hypothetical protein  51.78 
 
 		 466 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.241117  normal  0.237924 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0840  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  60.56 
 
 		 445 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0229  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  49.04 
 
 		 441 aa  204  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6702  hypothetical protein  55.6 
 
 		 423 aa  202  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6182  hypothetical protein  55.04 
 
 		 414 aa  187  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7050  hypothetical protein  46.44 
 
 		 391 aa  176  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5246  hypothetical protein  37.6 
 
 		 357 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.458222 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5526  hypothetical protein  37 
 
 		 343 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568584 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0909  hypothetical protein  34.88 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000691301  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1748  hypothetical protein  31.72 
 
 		 413 aa  70.9  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000762917  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0611  hypothetical protein  30.26 
 
 		 438 aa  60.5  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.236584  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0762  hypothetical protein  30.26 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0758  hypothetical protein  30.26 
 
 		 402 aa  59.3  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.679928 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0606  hypothetical protein  30.26 
 
 		 421 aa  59.7  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.565988  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  39.22 
 
 		 2851 aa  50.4  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0201  hypothetical protein  29.08 
 
 		 429 aa  49.3  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.640363  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1195  hypothetical protein  27.97 
 
 		 572 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.91759  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>