22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0840 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0840  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  100 
 
 
445 aa  797    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4781  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  76.28 
 
 
438 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6702  hypothetical protein  55.7 
 
 
423 aa  239  8e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3550  putative signal peptide  50.82 
 
 
438 aa  229  8e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.693928 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0785  hypothetical protein  50.79 
 
 
466 aa  219  6e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.241117  normal  0.237924 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6182  hypothetical protein  56.08 
 
 
414 aa  216  9e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329272  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0229  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  42.98 
 
 
441 aa  194  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7050  hypothetical protein  45.16 
 
 
391 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5246  hypothetical protein  37.17 
 
 
357 aa  94  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.458222 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5526  hypothetical protein  38.67 
 
 
343 aa  93.2  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00568584 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0909  hypothetical protein  33.71 
 
 
307 aa  77.8  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000691301  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1195  hypothetical protein  35.74 
 
 
572 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.91759  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1226  hypothetical protein  35.74 
 
 
572 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.342125  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0201  hypothetical protein  33.05 
 
 
429 aa  60.5  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.640363  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0611  hypothetical protein  35.11 
 
 
438 aa  59.7  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.236584  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4221  hypothetical protein  34.73 
 
 
571 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.583626 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0762  hypothetical protein  35.11 
 
 
415 aa  59.3  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0606  hypothetical protein  35.11 
 
 
421 aa  59.3  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.565988  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0758  hypothetical protein  35.11 
 
 
402 aa  58.9  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.679928 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1748  hypothetical protein  29.74 
 
 
413 aa  57.4  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000762917  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  39.16 
 
 
2851 aa  50.1  0.00009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1585  hypothetical protein  33.87 
 
 
405 aa  48.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000305006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>