22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7050 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7050  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  744    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0229  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  38.85 
 
 		 441 aa  159  6e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3550  putative signal peptide  44.38 
 
 		 438 aa  155  9e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.693928 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0785  hypothetical protein  40.83 
 
 		 466 aa  151  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.241117  normal  0.237924 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4781  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  43.38 
 
 		 438 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6182  hypothetical protein  41.84 
 
 		 414 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6702  hypothetical protein  40.72 
 
 		 423 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0840  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  40.48 
 
 		 445 aa  117  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5246  hypothetical protein  40 
 
 		 357 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.458222 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5526  hypothetical protein  39.5 
 
 		 343 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568584 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1748  hypothetical protein  33.06 
 
 		 413 aa  72.8  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000762917  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0201  hypothetical protein  32.73 
 
 		 429 aa  62  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.640363  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4221  hypothetical protein  32.44 
 
 		 571 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.583626 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0909  hypothetical protein  29.07 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000691301  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0762  hypothetical protein  28.89 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0611  hypothetical protein  28.89 
 
 		 438 aa  56.2  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.236584  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1226  hypothetical protein  32.09 
 
 		 572 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.342125  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1195  hypothetical protein  34.13 
 
 		 572 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.91759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0758  hypothetical protein  28.44 
 
 		 402 aa  54.3  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.679928 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0606  hypothetical protein  28.44 
 
 		 421 aa  54.3  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.565988  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1228  hypothetical protein  31.21 
 
 		 524 aa  48.9  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.150843  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  36 
 
 		 2851 aa  47.8  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>