20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0785 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0785  hypothetical protein  100 
 
 		 466 aa  898    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.241117  normal  0.237924 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4781  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  51.56 
 
 		 438 aa  211  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0229  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  47.87 
 
 		 441 aa  206  9e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3550  putative signal peptide  51.46 
 
 		 438 aa  190  5e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.693928 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0840  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  50.68 
 
 		 445 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6702  hypothetical protein  47.3 
 
 		 423 aa  182  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6182  hypothetical protein  50.38 
 
 		 414 aa  170  6e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7050  hypothetical protein  41.03 
 
 		 391 aa  144  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5246  hypothetical protein  33.77 
 
 		 357 aa  80.1  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.458222 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5526  hypothetical protein  35.45 
 
 		 343 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568584 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0909  hypothetical protein  33.92 
 
 		 307 aa  67  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000691301  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0201  hypothetical protein  34.72 
 
 		 429 aa  62  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.640363  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1195  hypothetical protein  29.79 
 
 		 572 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.91759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4221  hypothetical protein  29.79 
 
 		 571 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.583626 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1226  hypothetical protein  29.79 
 
 		 572 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.342125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1748  hypothetical protein  26.76 
 
 		 413 aa  53.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000762917  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0762  hypothetical protein  32.14 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0611  hypothetical protein  32.14 
 
 		 438 aa  52.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.236584  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0758  hypothetical protein  30.94 
 
 		 402 aa  51.2  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.679928 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0606  hypothetical protein  30.94 
 
 		 421 aa  51.2  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.565988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>