22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0611 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0611  hypothetical protein  100 
 
 		 438 aa  869    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.236584  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0606  hypothetical protein  87.67 
 
 		 421 aa  657    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.565988  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0762  hypothetical protein  100 
 
 		 415 aa  820    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0758  hypothetical protein  88.19 
 
 		 402 aa  625  1e-178  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.679928 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0201  hypothetical protein  27.82 
 
 		 429 aa  91.7  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.640363  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1748  hypothetical protein  30.28 
 
 		 413 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000762917  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6702  hypothetical protein  31.99 
 
 		 423 aa  63.2  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0909  hypothetical protein  26.05 
 
 		 307 aa  62.8  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000691301  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0235  hypothetical protein  31.76 
 
 		 486 aa  61.6  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0416653  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7050  hypothetical protein  29.54 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6182  hypothetical protein  33.33 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0840  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  35.03 
 
 		 445 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3452  hypothetical protein  33.86 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.149809  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0785  hypothetical protein  32.2 
 
 		 466 aa  53.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.241117  normal  0.237924 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3550  putative signal peptide  28.12 
 
 		 438 aa  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.693928 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2185  fibronectin, type III  30.57 
 
 		 656 aa  52.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0292079  hitchhiker  0.000132126 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0581  cell surface protein  54.05 
 
 		 941 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4781  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  29.86 
 
 		 438 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4221  hypothetical protein  29.41 
 
 		 571 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.583626 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1195  hypothetical protein  32.26 
 
 		 572 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.91759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0229  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  30.77 
 
 		 441 aa  45.1  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1228  hypothetical protein  26.89 
 
 		 524 aa  45.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.150843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>