19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0201 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0201  hypothetical protein  100 
 
 		 429 aa  822    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.640363  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0762  hypothetical protein  26.43 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0611  hypothetical protein  26.43 
 
 		 438 aa  79.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.236584  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0606  hypothetical protein  27.31 
 
 		 421 aa  69.3  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.565988  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0758  hypothetical protein  27.31 
 
 		 402 aa  69.3  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.679928 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1195  hypothetical protein  33.33 
 
 		 572 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.91759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4221  hypothetical protein  33.8 
 
 		 571 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.583626 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7050  hypothetical protein  32.73 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1226  hypothetical protein  32.52 
 
 		 572 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.342125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6702  hypothetical protein  36.99 
 
 		 423 aa  57  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0235  hypothetical protein  29.41 
 
 		 486 aa  56.6  0.0000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0416653  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0785  hypothetical protein  32.49 
 
 		 466 aa  56.2  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.241117  normal  0.237924 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0840  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  33.92 
 
 		 445 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4781  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  37.93 
 
 		 438 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1748  hypothetical protein  34.19 
 
 		 413 aa  49.7  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000762917  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0909  hypothetical protein  27.81 
 
 		 307 aa  48.5  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000691301  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6182  hypothetical protein  35.65 
 
 		 414 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1585  hypothetical protein  40.24 
 
 		 405 aa  43.9  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000305006  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1228  hypothetical protein  27 
 
 		 524 aa  44.3  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.150843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>