19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0758 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0606  hypothetical protein  100 
 
 		 421 aa  796    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.565988  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0758  hypothetical protein  100 
 
 		 402 aa  795    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.679928 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0611  hypothetical protein  88.19 
 
 		 438 aa  626  1e-178  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.236584  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0762  hypothetical protein  88.19 
 
 		 415 aa  625  1e-178  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0201  hypothetical protein  29.46 
 
 		 429 aa  81.3  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.640363  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1748  hypothetical protein  29.14 
 
 		 413 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000762917  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0909  hypothetical protein  26.05 
 
 		 307 aa  62.4  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000691301  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7050  hypothetical protein  28.69 
 
 		 391 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6182  hypothetical protein  33.33 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0840  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  35.03 
 
 		 445 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3452  hypothetical protein  33.33 
 
 		 407 aa  56.2  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.149809  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0235  hypothetical protein  30.41 
 
 		 486 aa  55.8  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0416653  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6702  hypothetical protein  30.75 
 
 		 423 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0785  hypothetical protein  31.25 
 
 		 466 aa  51.6  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.241117  normal  0.237924 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3550  putative signal peptide  29.02 
 
 		 438 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.693928 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4781  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  30.56 
 
 		 438 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2185  fibronectin, type III  30.05 
 
 		 656 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0292079  hitchhiker  0.000132126 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4221  hypothetical protein  30.99 
 
 		 571 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.583626 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1228  hypothetical protein  26.89 
 
 		 524 aa  43.1  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.150843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>