25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6702 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6702  hypothetical protein  100 
 
 		 423 aa  751    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6182  hypothetical protein  75.78 
 
 		 414 aa  347  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4781  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  59.36 
 
 		 438 aa  235  9e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3550  putative signal peptide  47.63 
 
 		 438 aa  197  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.693928 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0229  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  45.59 
 
 		 441 aa  191  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0785  hypothetical protein  46.48 
 
 		 466 aa  189  5.999999999999999e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.241117  normal  0.237924 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0840  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  52.53 
 
 		 445 aa  189  8e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7050  hypothetical protein  38.56 
 
 		 391 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5526  hypothetical protein  39.39 
 
 		 343 aa  99.8  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568584 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5246  hypothetical protein  37.04 
 
 		 357 aa  97.1  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.458222 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1748  hypothetical protein  29.32 
 
 		 413 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000762917  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4221  hypothetical protein  34.83 
 
 		 571 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.583626 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1195  hypothetical protein  35.21 
 
 		 572 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.91759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0909  hypothetical protein  29.22 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000691301  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1226  hypothetical protein  35.69 
 
 		 572 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.342125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0201  hypothetical protein  37.59 
 
 		 429 aa  57.8  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.640363  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0762  hypothetical protein  30.63 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  40.65 
 
 		 2914 aa  57  0.0000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0611  hypothetical protein  30.88 
 
 		 438 aa  57  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.236584  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  38.46 
 
 		 2851 aa  53.5  0.000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1228  hypothetical protein  28.99 
 
 		 524 aa  53.9  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.150843  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0758  hypothetical protein  29.47 
 
 		 402 aa  50.1  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.679928 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0410  hypothetical protein  37.23 
 
 		 314 aa  48.9  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0606  hypothetical protein  29.47 
 
 		 421 aa  49.3  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.565988  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  33.63 
 
 		 2397 aa  43.1  0.01  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>