25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0706 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0706  hypothetical protein  100 
 
 		 553 aa  1087    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.31357  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1761  cytochrome c family protein  45.59 
 
 		 511 aa  158  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0745977  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0235  hypothetical protein  35.82 
 
 		 486 aa  156  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0416653  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2185  fibronectin, type III  40.56 
 
 		 656 aa  154  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0292079  hitchhiker  0.000132126 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2832  hypothetical protein  33.1 
 
 		 465 aa  121  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.907997  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1881  cytochrome c family protein  45.51 
 
 		 510 aa  106  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3361  hypothetical protein  28.81 
 
 		 466 aa  99.8  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623188  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4011  hypothetical protein  29.14 
 
 		 390 aa  98.6  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3452  hypothetical protein  34.06 
 
 		 407 aa  91.3  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.149809  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2329  cytochrome c family protein  41.79 
 
 		 442 aa  87.4  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1228  hypothetical protein  32.53 
 
 		 524 aa  82  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.150843  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3019  hypothetical protein  32.87 
 
 		 476 aa  76.6  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1585  hypothetical protein  29.33 
 
 		 405 aa  59.7  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000305006  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2022  fibronectin, type III domain-containing protein  55.1 
 
 		 683 aa  59.7  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00638663  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1191  hypothetical protein  61.11 
 
 		 184 aa  57  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0721  hypothetical protein  33.33 
 
 		 741 aa  56.6  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0534  hypothetical protein  49.15 
 
 		 182 aa  56.6  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1087  cytochrome c family protein, putative  41.46 
 
 		 148 aa  56.6  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000224784  hitchhiker  0.0000155568 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2573  hypothetical protein  35.64 
 
 		 523 aa  56.2  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000703418 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2515  cytochrome c family protein, putative  42.5 
 
 		 141 aa  55.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.235235  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1762  Cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  32.14 
 
 		 585 aa  52.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901086  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1748  hypothetical protein  27.46 
 
 		 413 aa  52  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000762917  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1037  hypothetical protein  33.68 
 
 		 409 aa  50.4  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0570191 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3016  hypothetical protein  28.33 
 
 		 500 aa  48.1  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001592  putative lipoprotein  29.07 
 
 		 399 aa  43.9  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000686161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>