15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4011 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_4011  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  765    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3361  hypothetical protein  97.15 
 
 		 466 aa  651    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623188  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2832  hypothetical protein  37.5 
 
 		 465 aa  176  8e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.907997  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3452  hypothetical protein  32.82 
 
 		 407 aa  93.6  6e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.149809  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0706  hypothetical protein  28.67 
 
 		 553 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.31357  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0235  hypothetical protein  27.2 
 
 		 486 aa  76.3  0.0000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0416653  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1228  hypothetical protein  28.57 
 
 		 524 aa  74.7  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.150843  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2573  hypothetical protein  29.48 
 
 		 523 aa  63.9  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000703418 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1037  hypothetical protein  27.36 
 
 		 409 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0570191 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2185  fibronectin, type III  26.11 
 
 		 656 aa  52.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0292079  hitchhiker  0.000132126 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1960  hypothetical protein  54.35 
 
 		 325 aa  50.4  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3019  hypothetical protein  25.17 
 
 		 476 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1585  hypothetical protein  27.45 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000305006  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33987  predicted protein  48.72 
 
 		 432 aa  44.3  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05569  hypothetical protein  24.68 
 
 		 393 aa  43.1  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>