15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3019 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3019  hypothetical protein  100 
 
 
476 aa  926    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3016  hypothetical protein  38.41 
 
 
500 aa  241  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0235  hypothetical protein  27.49 
 
 
486 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0416653  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0706  hypothetical protein  33.99 
 
 
553 aa  92.8  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.31357  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1228  hypothetical protein  28.61 
 
 
524 aa  86.7  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.150843  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2832  hypothetical protein  27.99 
 
 
465 aa  71.2  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.907997  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1037  hypothetical protein  34.48 
 
 
409 aa  71.2  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0570191 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2185  fibronectin, type III  27.03 
 
 
656 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0292079  hitchhiker  0.000132126 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3452  hypothetical protein  37.93 
 
 
407 aa  66.6  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.149809  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0721  hypothetical protein  29.7 
 
 
741 aa  62  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3361  hypothetical protein  25.59 
 
 
466 aa  58.2  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623188  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4011  hypothetical protein  25.25 
 
 
390 aa  57  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4636  putative lipoprotein  25.06 
 
 
425 aa  56.2  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3012  lipoprotein  26.09 
 
 
437 aa  55.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.214836  normal  0.364321 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1585  hypothetical protein  25.4 
 
 
405 aa  51.6  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000305006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>