12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3016 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3016  hypothetical protein  100 
 
 
500 aa  989    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3019  hypothetical protein  37.34 
 
 
476 aa  217  5e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0235  hypothetical protein  29.43 
 
 
486 aa  103  8e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0416653  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1228  hypothetical protein  26.23 
 
 
524 aa  62.4  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.150843  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2832  hypothetical protein  24.66 
 
 
465 aa  62.4  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.907997  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1585  hypothetical protein  30.51 
 
 
405 aa  59.3  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000305006  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2185  fibronectin, type III  27.84 
 
 
656 aa  54.7  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0292079  hitchhiker  0.000132126 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0721  hypothetical protein  28.12 
 
 
741 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0706  hypothetical protein  26.27 
 
 
553 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.31357  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4011  hypothetical protein  25.36 
 
 
390 aa  47.4  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3361  hypothetical protein  24.78 
 
 
466 aa  43.5  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623188  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1037  hypothetical protein  26.07 
 
 
409 aa  43.1  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0570191 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>