15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2832 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2832  hypothetical protein  100 
 
 		 465 aa  893    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.907997  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3361  hypothetical protein  37.46 
 
 		 466 aa  182  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623188  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4011  hypothetical protein  37.79 
 
 		 390 aa  179  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0706  hypothetical protein  33.68 
 
 		 553 aa  121  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.31357  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3452  hypothetical protein  31.17 
 
 		 407 aa  105  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.149809  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0235  hypothetical protein  31.53 
 
 		 486 aa  103  8e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0416653  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1228  hypothetical protein  30.77 
 
 		 524 aa  97.8  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.150843  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2185  fibronectin, type III  32.51 
 
 		 656 aa  94.7  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0292079  hitchhiker  0.000132126 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1585  hypothetical protein  28.02 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000305006  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1037  hypothetical protein  27.8 
 
 		 409 aa  67  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0570191 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3019  hypothetical protein  27.4 
 
 		 476 aa  63.2  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3016  hypothetical protein  24.66 
 
 		 500 aa  60.5  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0938  hypothetical protein  33.79 
 
 		 418 aa  50.1  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0721  hypothetical protein  27.42 
 
 		 741 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4636  putative lipoprotein  29.22 
 
 		 425 aa  46.2  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>