34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1191 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1191  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  351  4e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0534  hypothetical protein  42.54 
 
 		 182 aa  105  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1881  cytochrome c family protein  61.54 
 
 		 510 aa  77  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2329  cytochrome c family protein  68 
 
 		 442 aa  71.2  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2022  fibronectin, type III domain-containing protein  69.77 
 
 		 683 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00638663  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2185  fibronectin, type III  50 
 
 		 656 aa  59.3  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0292079  hitchhiker  0.000132126 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0706  hypothetical protein  61.11 
 
 		 553 aa  56.6  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.31357  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1761  cytochrome c family protein  52.24 
 
 		 511 aa  53.9  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0745977  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1087  cytochrome c family protein, putative  42.68 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000224784  hitchhiker  0.0000155568 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2515  cytochrome c family protein, putative  35.79 
 
 		 141 aa  48.1  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.235235  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2288  serine/threonine protein kinase  38.89 
 
 		 771 aa  48.1  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000513908 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  49.28 
 
 		 555 aa  48.1  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  48.44 
 
 		 268 aa  47  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  48.61 
 
 		 840 aa  47  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  29.91 
 
 		 407 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  36.21 
 
 		 667 aa  46.2  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  36.11 
 
 		 491 aa  47  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  48.48 
 
 		 551 aa  46.2  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  43.48 
 
 		 433 aa  46.2  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.67 
 
 		 444 aa  45.4  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  33.33 
 
 		 458 aa  45.1  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45682  predicted protein  40.98 
 
 		 633 aa  45.1  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  36.14 
 
 		 778 aa  44.7  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.86 
 
 		 261 aa  44.7  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44995  predicted protein  57.14 
 
 		 1217 aa  44.3  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00833272  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3800  heat shock protein 70  46.55 
 
 		 880 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.122258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  46.97 
 
 		 522 aa  43.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.85 
 
 		 257 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  47.27 
 
 		 1281 aa  42  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  25.41 
 
 		 1000 aa  42  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  40.32 
 
 		 489 aa  42  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30179  hypothetical protein  30.95 
 
 		 617 aa  42  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0761319 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  38.24 
 
 		 2313 aa  41.6  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  43.53 
 
 		 671 aa  41.6  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>